Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FANCCQ00597 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FANCCQ00597 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FANCCQ00597 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FANCCQ00597 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FANCCQ00597 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FANCCQ00597 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FANCCQ00597 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FANCCQ00597 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FANCCQ00597 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FANCCQ00597 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FANCCQ00597 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FANCCQ00597 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FANCCQ00597 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FANCCQ00597 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FANCCQ00597 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FANCCQ00597 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FANCCQ00597 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FANCCQ00597 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FANCCQ00597 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FANCCQ00597 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
FANCCQ00597 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
FANCCQ00597 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FANCCQ00597 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FANCCQ00597 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FANCCQ00597 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FANCCQ00597 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FANCCQ00597 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FANCCQ00597 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FANCCQ00597 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FANCCQ00597 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
FANCCQ00597 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FANCCQ00597 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FANCCQ00597 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FANCCQ00597 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FANCCQ00597 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FANCCQ00597 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FANCCQ00597 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FANCCQ00597 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FANCCQ00597 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FANCCQ00597 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FANCCQ00597 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FANCCQ00597 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FANCCQ00597 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FANCCQ00597 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FANCCQ00597 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FANCCQ00597 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FANCCQ00597 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FANCCQ00597 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FANCCQ00597 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FANCCQ00597 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FANCCQ00597 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FANCCQ00597 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FANCCQ00597 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FANCCQ00597 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FANCCQ00597 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FANCCQ00597 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FANCCQ00597 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FANCCQ00597 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FANCCQ00597 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FANCCQ00597 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FANCCQ00597 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FANCCQ00597 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FANCCQ00597 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FANCCQ00597 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FANCCQ00597 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FANCCQ00597 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FANCCQ00597 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
FANCCQ00597 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms