Protein–RNA interactions for Protein: P62753

RPS6, 40S ribosomal protein S6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6P62753 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPS6P62753 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RPS6P62753 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPS6P62753 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPS6P62753 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPS6P62753 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPS6P62753 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RPS6P62753 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RPS6P62753 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RPS6P62753 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPS6P62753 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RPS6P62753 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPS6P62753 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RPS6P62753 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPS6P62753 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPS6P62753 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPS6P62753 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RPS6P62753 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RPS6P62753 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
RPS6P62753 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RPS6P62753 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPS6P62753 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPS6P62753 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPS6P62753 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPS6P62753 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPS6P62753 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPS6P62753 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPS6P62753 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RPS6P62753 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPS6P62753 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPS6P62753 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPS6P62753 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPS6P62753 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPS6P62753 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPS6P62753 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPS6P62753 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPS6P62753 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPS6P62753 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPS6P62753 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPS6P62753 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPS6P62753 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPS6P62753 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPS6P62753 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPS6P62753 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPS6P62753 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPS6P62753 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPS6P62753 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPS6P62753 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPS6P62753 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPS6P62753 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPS6P62753 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPS6P62753 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPS6P62753 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPS6P62753 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPS6P62753 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPS6P62753 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPS6P62753 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPS6P62753 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPS6P62753 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPS6P62753 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPS6P62753 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPS6P62753 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPS6P62753 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPS6P62753 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPS6P62753 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPS6P62753 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPS6P62753 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPS6P62753 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPS6P62753 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPS6P62753 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPS6P62753 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPS6P62753 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPS6P62753 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPS6P62753 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPS6P62753 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPS6P62753 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPS6P62753 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPS6P62753 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPS6P62753 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPS6P62753 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPS6P62753 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RPS6P62753 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RPS6P62753 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RPS6P62753 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RPS6P62753 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPS6P62753 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPS6P62753 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPS6P62753 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RPS6P62753 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPS6P62753 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPS6P62753 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPS6P62753 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RPS6P62753 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPS6P62753 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPS6P62753 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPS6P62753 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPS6P62753 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPS6P62753 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPS6P62753 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPS6P62753 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.7 ms