Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR2FP61218 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR2FP61218 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR2FP61218 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR2FP61218 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR2FP61218 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR2FP61218 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR2FP61218 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
POLR2FP61218 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR2FP61218 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR2FP61218 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR2FP61218 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR2FP61218 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR2FP61218 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR2FP61218 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR2FP61218 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR2FP61218 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR2FP61218 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR2FP61218 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR2FP61218 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR2FP61218 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR2FP61218 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR2FP61218 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR2FP61218 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2FP61218 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2FP61218 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2FP61218 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2FP61218 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR2FP61218 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR2FP61218 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR2FP61218 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR2FP61218 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR2FP61218 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR2FP61218 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR2FP61218 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR2FP61218 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR2FP61218 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR2FP61218 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR2FP61218 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR2FP61218 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR2FP61218 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR2FP61218 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR2FP61218 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR2FP61218 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR2FP61218 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR2FP61218 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR2FP61218 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR2FP61218 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR2FP61218 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR2FP61218 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR2FP61218 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR2FP61218 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR2FP61218 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR2FP61218 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR2FP61218 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR2FP61218 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR2FP61218 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR2FP61218 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR2FP61218 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR2FP61218 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR2FP61218 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR2FP61218 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR2FP61218 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR2FP61218 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR2FP61218 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR2FP61218 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR2FP61218 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR2FP61218 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR2FP61218 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR2FP61218 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR2FP61218 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR2FP61218 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR2FP61218 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR2FP61218 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR2FP61218 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR2FP61218 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
POLR2FP61218 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR2FP61218 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR2FP61218 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR2FP61218 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR2FP61218 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR2FP61218 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR2FP61218 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR2FP61218 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR2FP61218 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR2FP61218 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR2FP61218 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR2FP61218 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR2FP61218 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR2FP61218 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR2FP61218 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR2FP61218 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR2FP61218 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR2FP61218 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2FP61218 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2FP61218 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2FP61218 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2FP61218 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2FP61218 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2FP61218 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms