Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PMS1P54277 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PMS1P54277 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PMS1P54277 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PMS1P54277 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PMS1P54277 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PMS1P54277 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PMS1P54277 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PMS1P54277 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PMS1P54277 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PMS1P54277 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PMS1P54277 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PMS1P54277 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PMS1P54277 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PMS1P54277 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PMS1P54277 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PMS1P54277 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PMS1P54277 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PMS1P54277 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PMS1P54277 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PMS1P54277 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PMS1P54277 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PMS1P54277 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PMS1P54277 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PMS1P54277 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PMS1P54277 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PMS1P54277 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PMS1P54277 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PMS1P54277 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PMS1P54277 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PMS1P54277 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PMS1P54277 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PMS1P54277 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PMS1P54277 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PMS1P54277 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PMS1P54277 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PMS1P54277 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PMS1P54277 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PMS1P54277 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PMS1P54277 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PMS1P54277 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PMS1P54277 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PMS1P54277 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PMS1P54277 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PMS1P54277 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PMS1P54277 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PMS1P54277 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PMS1P54277 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PMS1P54277 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
PMS1P54277 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PMS1P54277 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PMS1P54277 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PMS1P54277 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PMS1P54277 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PMS1P54277 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PMS1P54277 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PMS1P54277 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PMS1P54277 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PMS1P54277 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PMS1P54277 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PMS1P54277 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PMS1P54277 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PMS1P54277 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PMS1P54277 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PMS1P54277 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PMS1P54277 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PMS1P54277 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PMS1P54277 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PMS1P54277 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PMS1P54277 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PMS1P54277 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PMS1P54277 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PMS1P54277 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PMS1P54277 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PMS1P54277 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PMS1P54277 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PMS1P54277 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PMS1P54277 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PMS1P54277 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PMS1P54277 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PMS1P54277 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PMS1P54277 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PMS1P54277 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PMS1P54277 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PMS1P54277 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PMS1P54277 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PMS1P54277 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PMS1P54277 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PMS1P54277 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PMS1P54277 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PMS1P54277 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PMS1P54277 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PMS1P54277 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PMS1P54277 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PMS1P54277 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PMS1P54277 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PMS1P54277 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PMS1P54277 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PMS1P54277 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PMS1P54277 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms