Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VEGFBP49765 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
VEGFBP49765 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
VEGFBP49765 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
VEGFBP49765 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
VEGFBP49765 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
VEGFBP49765 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
VEGFBP49765 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
VEGFBP49765 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
VEGFBP49765 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
VEGFBP49765 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VEGFBP49765 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VEGFBP49765 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VEGFBP49765 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VEGFBP49765 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
VEGFBP49765 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
VEGFBP49765 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
VEGFBP49765 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VEGFBP49765 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
VEGFBP49765 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VEGFBP49765 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VEGFBP49765 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VEGFBP49765 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VEGFBP49765 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VEGFBP49765 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
VEGFBP49765 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VEGFBP49765 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VEGFBP49765 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
VEGFBP49765 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VEGFBP49765 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VEGFBP49765 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
VEGFBP49765 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
VEGFBP49765 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VEGFBP49765 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
VEGFBP49765 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
VEGFBP49765 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
VEGFBP49765 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VEGFBP49765 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
VEGFBP49765 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VEGFBP49765 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VEGFBP49765 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VEGFBP49765 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VEGFBP49765 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VEGFBP49765 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VEGFBP49765 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
VEGFBP49765 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VEGFBP49765 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VEGFBP49765 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
VEGFBP49765 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
VEGFBP49765 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
VEGFBP49765 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
VEGFBP49765 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
VEGFBP49765 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
VEGFBP49765 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
VEGFBP49765 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
VEGFBP49765 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
VEGFBP49765 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
VEGFBP49765 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
VEGFBP49765 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
VEGFBP49765 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VEGFBP49765 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
VEGFBP49765 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
VEGFBP49765 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
VEGFBP49765 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
VEGFBP49765 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
VEGFBP49765 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VEGFBP49765 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VEGFBP49765 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VEGFBP49765 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
VEGFBP49765 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
VEGFBP49765 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
VEGFBP49765 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
VEGFBP49765 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
VEGFBP49765 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
VEGFBP49765 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VEGFBP49765 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
VEGFBP49765 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
VEGFBP49765 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
VEGFBP49765 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
VEGFBP49765 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VEGFBP49765 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VEGFBP49765 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VEGFBP49765 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
VEGFBP49765 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
VEGFBP49765 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
VEGFBP49765 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VEGFBP49765 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VEGFBP49765 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VEGFBP49765 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VEGFBP49765 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VEGFBP49765 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VEGFBP49765 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VEGFBP49765 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VEGFBP49765 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VEGFBP49765 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VEGFBP49765 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VEGFBP49765 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VEGFBP49765 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VEGFBP49765 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VEGFBP49765 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.1 ms