Protein–RNA interactions for Protein: P49593

PPM1F, Protein phosphatase 1F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1FP49593 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPM1FP49593 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPM1FP49593 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPM1FP49593 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPM1FP49593 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPM1FP49593 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPM1FP49593 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPM1FP49593 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPM1FP49593 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPM1FP49593 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPM1FP49593 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPM1FP49593 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPM1FP49593 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPM1FP49593 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPM1FP49593 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPM1FP49593 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPM1FP49593 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPM1FP49593 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPM1FP49593 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPM1FP49593 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPM1FP49593 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPM1FP49593 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPM1FP49593 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPM1FP49593 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPM1FP49593 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PPM1FP49593 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPM1FP49593 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPM1FP49593 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPM1FP49593 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPM1FP49593 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPM1FP49593 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPM1FP49593 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPM1FP49593 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPM1FP49593 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPM1FP49593 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPM1FP49593 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPM1FP49593 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPM1FP49593 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPM1FP49593 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPM1FP49593 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPM1FP49593 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPM1FP49593 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPM1FP49593 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPM1FP49593 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPM1FP49593 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPM1FP49593 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPM1FP49593 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPM1FP49593 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPM1FP49593 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPM1FP49593 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPM1FP49593 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPM1FP49593 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPM1FP49593 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPM1FP49593 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPM1FP49593 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1FP49593 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1FP49593 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1FP49593 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1FP49593 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1FP49593 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1FP49593 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1FP49593 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1FP49593 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1FP49593 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1FP49593 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1FP49593 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1FP49593 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1FP49593 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1FP49593 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1FP49593 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1FP49593 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1FP49593 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1FP49593 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1FP49593 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1FP49593 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1FP49593 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1FP49593 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1FP49593 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1FP49593 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1FP49593 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1FP49593 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1FP49593 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1FP49593 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1FP49593 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1FP49593 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1FP49593 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1FP49593 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1FP49593 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1FP49593 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1FP49593 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1FP49593 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1FP49593 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1FP49593 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1FP49593 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1FP49593 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPM1FP49593 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPM1FP49593 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPM1FP49593 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPM1FP49593 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPM1FP49593 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms