Protein–RNA interactions for Protein: P49006

MARCKSL1, MARCKS-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSL1P49006 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARCKSL1P49006 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARCKSL1P49006 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARCKSL1P49006 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARCKSL1P49006 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARCKSL1P49006 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARCKSL1P49006 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARCKSL1P49006 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARCKSL1P49006 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MARCKSL1P49006 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MARCKSL1P49006 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MARCKSL1P49006 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MARCKSL1P49006 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MARCKSL1P49006 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MARCKSL1P49006 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MARCKSL1P49006 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARCKSL1P49006 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARCKSL1P49006 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARCKSL1P49006 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MARCKSL1P49006 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MARCKSL1P49006 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MARCKSL1P49006 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCKSL1P49006 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCKSL1P49006 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCKSL1P49006 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCKSL1P49006 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCKSL1P49006 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MARCKSL1P49006 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MARCKSL1P49006 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MARCKSL1P49006 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MARCKSL1P49006 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MARCKSL1P49006 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MARCKSL1P49006 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MARCKSL1P49006 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARCKSL1P49006 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MARCKSL1P49006 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARCKSL1P49006 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCKSL1P49006 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCKSL1P49006 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCKSL1P49006 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCKSL1P49006 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCKSL1P49006 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCKSL1P49006 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCKSL1P49006 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCKSL1P49006 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCKSL1P49006 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCKSL1P49006 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCKSL1P49006 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms