Protein–RNA interactions for Protein: P43686

PSMC4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC4P43686 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSMC4P43686 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSMC4P43686 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSMC4P43686 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSMC4P43686 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSMC4P43686 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSMC4P43686 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSMC4P43686 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSMC4P43686 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSMC4P43686 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSMC4P43686 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSMC4P43686 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSMC4P43686 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSMC4P43686 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSMC4P43686 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSMC4P43686 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSMC4P43686 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSMC4P43686 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSMC4P43686 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSMC4P43686 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PSMC4P43686 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSMC4P43686 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSMC4P43686 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSMC4P43686 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSMC4P43686 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSMC4P43686 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMC4P43686 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMC4P43686 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMC4P43686 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMC4P43686 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMC4P43686 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PSMC4P43686 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSMC4P43686 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PSMC4P43686 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSMC4P43686 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSMC4P43686 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSMC4P43686 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSMC4P43686 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSMC4P43686 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSMC4P43686 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMC4P43686 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMC4P43686 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMC4P43686 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMC4P43686 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMC4P43686 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMC4P43686 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMC4P43686 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMC4P43686 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSMC4P43686 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSMC4P43686 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSMC4P43686 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSMC4P43686 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMC4P43686 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMC4P43686 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMC4P43686 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMC4P43686 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMC4P43686 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMC4P43686 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSMC4P43686 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSMC4P43686 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSMC4P43686 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PSMC4P43686 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSMC4P43686 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSMC4P43686 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSMC4P43686 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSMC4P43686 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSMC4P43686 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PSMC4P43686 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSMC4P43686 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSMC4P43686 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSMC4P43686 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSMC4P43686 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSMC4P43686 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSMC4P43686 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PSMC4P43686 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSMC4P43686 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMC4P43686 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMC4P43686 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMC4P43686 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMC4P43686 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMC4P43686 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMC4P43686 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMC4P43686 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMC4P43686 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSMC4P43686 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSMC4P43686 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSMC4P43686 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSMC4P43686 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PSMC4P43686 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSMC4P43686 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSMC4P43686 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSMC4P43686 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSMC4P43686 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMC4P43686 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMC4P43686 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMC4P43686 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMC4P43686 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMC4P43686 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMC4P43686 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMC4P43686 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms