Protein–RNA interactions for Protein: P42695

NCAPD3, Condensin-2 complex subunit D3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD3P42695 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC43.7■■■■■ 4.59
NCAPD3P42695 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
NCAPD3P42695 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC43.7■■■■■ 4.59
NCAPD3P42695 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.59
NCAPD3P42695 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
NCAPD3P42695 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
NCAPD3P42695 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC43.69■■■■■ 4.58
NCAPD3P42695 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
NCAPD3P42695 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.69■■■■■ 4.58
NCAPD3P42695 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.68■■■■■ 4.58
NCAPD3P42695 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
NCAPD3P42695 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
NCAPD3P42695 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC43.68■■■■■ 4.58
NCAPD3P42695 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC43.68■■■■■ 4.58
NCAPD3P42695 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC43.68■■■■■ 4.58
NCAPD3P42695 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC43.68■■■■■ 4.58
NCAPD3P42695 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC43.68■■■■■ 4.58
NCAPD3P42695 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC43.68■■■■■ 4.58
NCAPD3P42695 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC43.67■■■■■ 4.58
NCAPD3P42695 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.66■■■■■ 4.58
NCAPD3P42695 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC43.66■■■■■ 4.58
NCAPD3P42695 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
NCAPD3P42695 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC43.66■■■■■ 4.58
NCAPD3P42695 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
NCAPD3P42695 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC43.65■■■■■ 4.58
NCAPD3P42695 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC43.65■■■■■ 4.58
NCAPD3P42695 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.65■■■■■ 4.58
NCAPD3P42695 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
NCAPD3P42695 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.64■■■■■ 4.58
NCAPD3P42695 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.64■■■■■ 4.58
NCAPD3P42695 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC43.64■■■■■ 4.58
NCAPD3P42695 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
NCAPD3P42695 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC43.64■■■■■ 4.58
NCAPD3P42695 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
NCAPD3P42695 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC43.63■■■■■ 4.58
NCAPD3P42695 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
NCAPD3P42695 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC43.63■■■■■ 4.57
NCAPD3P42695 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.63■■■■■ 4.57
NCAPD3P42695 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
NCAPD3P42695 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC43.62■■■■■ 4.57
NCAPD3P42695 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC43.61■■■■■ 4.57
NCAPD3P42695 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC43.6■■■■■ 4.57
NCAPD3P42695 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
NCAPD3P42695 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
NCAPD3P42695 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
NCAPD3P42695 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC43.6■■■■■ 4.57
NCAPD3P42695 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.59■■■■■ 4.57
NCAPD3P42695 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC43.59■■■■■ 4.57
NCAPD3P42695 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC43.59■■■■■ 4.57
NCAPD3P42695 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
NCAPD3P42695 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC43.58■■■■■ 4.57
NCAPD3P42695 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
NCAPD3P42695 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC43.58■■■■■ 4.57
NCAPD3P42695 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
NCAPD3P42695 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
NCAPD3P42695 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC43.56■■■■■ 4.56
NCAPD3P42695 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
NCAPD3P42695 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC43.55■■■■■ 4.56
NCAPD3P42695 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC43.54■■■■■ 4.56
NCAPD3P42695 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
NCAPD3P42695 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
NCAPD3P42695 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
NCAPD3P42695 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC43.52■■■■■ 4.56
NCAPD3P42695 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC43.52■■■■■ 4.56
NCAPD3P42695 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
NCAPD3P42695 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC43.51■■■■■ 4.56
NCAPD3P42695 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC43.51■■■■■ 4.56
NCAPD3P42695 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
NCAPD3P42695 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
NCAPD3P42695 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
NCAPD3P42695 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
NCAPD3P42695 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC43.5■■■■■ 4.55
NCAPD3P42695 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC43.49■■■■■ 4.55
NCAPD3P42695 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC43.48■■■■■ 4.55
NCAPD3P42695 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
NCAPD3P42695 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC43.47■■■■■ 4.55
NCAPD3P42695 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
NCAPD3P42695 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC43.46■■■■■ 4.55
NCAPD3P42695 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC43.46■■■■■ 4.55
NCAPD3P42695 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC43.46■■■■■ 4.55
NCAPD3P42695 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC43.45■■■■■ 4.55
NCAPD3P42695 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC43.45■■■■■ 4.55
NCAPD3P42695 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC43.45■■■■■ 4.55
NCAPD3P42695 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC43.44■■■■■ 4.55
NCAPD3P42695 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC43.44■■■■■ 4.54
NCAPD3P42695 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
NCAPD3P42695 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
NCAPD3P42695 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC43.44■■■■■ 4.54
NCAPD3P42695 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
NCAPD3P42695 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC43.43■■■■■ 4.54
NCAPD3P42695 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC43.43■■■■■ 4.54
NCAPD3P42695 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
NCAPD3P42695 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.43■■■■■ 4.54
NCAPD3P42695 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
NCAPD3P42695 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
NCAPD3P42695 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.4■■■■■ 4.54
NCAPD3P42695 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
NCAPD3P42695 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC43.39■■■■■ 4.54
NCAPD3P42695 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.54
NCAPD3P42695 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms