Protein–RNA interactions for Protein: P41732

TSPAN7, Tetraspanin-7, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN7P41732 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN7P41732 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN7P41732 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN7P41732 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN7P41732 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN7P41732 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN7P41732 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN7P41732 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN7P41732 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSPAN7P41732 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN7P41732 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN7P41732 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN7P41732 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN7P41732 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN7P41732 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN7P41732 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN7P41732 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN7P41732 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN7P41732 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN7P41732 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN7P41732 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN7P41732 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN7P41732 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN7P41732 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN7P41732 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN7P41732 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN7P41732 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN7P41732 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN7P41732 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN7P41732 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN7P41732 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN7P41732 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN7P41732 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN7P41732 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN7P41732 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN7P41732 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN7P41732 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN7P41732 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN7P41732 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN7P41732 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN7P41732 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN7P41732 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN7P41732 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN7P41732 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN7P41732 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN7P41732 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN7P41732 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN7P41732 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TSPAN7P41732 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN7P41732 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN7P41732 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN7P41732 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms