Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARL1P40616 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARL1P40616 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARL1P40616 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARL1P40616 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARL1P40616 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARL1P40616 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARL1P40616 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARL1P40616 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARL1P40616 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARL1P40616 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARL1P40616 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARL1P40616 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARL1P40616 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARL1P40616 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARL1P40616 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARL1P40616 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARL1P40616 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARL1P40616 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARL1P40616 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARL1P40616 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARL1P40616 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARL1P40616 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARL1P40616 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARL1P40616 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARL1P40616 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARL1P40616 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARL1P40616 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARL1P40616 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARL1P40616 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARL1P40616 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARL1P40616 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARL1P40616 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARL1P40616 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARL1P40616 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARL1P40616 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARL1P40616 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARL1P40616 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARL1P40616 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARL1P40616 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARL1P40616 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARL1P40616 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARL1P40616 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARL1P40616 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARL1P40616 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARL1P40616 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARL1P40616 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARL1P40616 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARL1P40616 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARL1P40616 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARL1P40616 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARL1P40616 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARL1P40616 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARL1P40616 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARL1P40616 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARL1P40616 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARL1P40616 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARL1P40616 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARL1P40616 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARL1P40616 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARL1P40616 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARL1P40616 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARL1P40616 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARL1P40616 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARL1P40616 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARL1P40616 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ARL1P40616 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARL1P40616 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARL1P40616 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARL1P40616 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARL1P40616 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARL1P40616 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARL1P40616 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARL1P40616 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARL1P40616 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARL1P40616 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARL1P40616 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARL1P40616 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARL1P40616 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARL1P40616 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARL1P40616 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARL1P40616 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARL1P40616 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARL1P40616 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARL1P40616 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARL1P40616 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARL1P40616 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARL1P40616 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARL1P40616 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARL1P40616 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARL1P40616 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ARL1P40616 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARL1P40616 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARL1P40616 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARL1P40616 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARL1P40616 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARL1P40616 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARL1P40616 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARL1P40616 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARL1P40616 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.7 ms