Protein–RNA interactions for Protein: P30939

HTR1F, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1FP30939 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR1FP30939 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR1FP30939 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR1FP30939 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR1FP30939 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR1FP30939 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR1FP30939 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR1FP30939 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR1FP30939 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR1FP30939 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR1FP30939 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR1FP30939 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR1FP30939 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR1FP30939 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HTR1FP30939 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTR1FP30939 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTR1FP30939 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTR1FP30939 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTR1FP30939 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTR1FP30939 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTR1FP30939 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTR1FP30939 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTR1FP30939 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTR1FP30939 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTR1FP30939 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR1FP30939 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR1FP30939 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR1FP30939 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR1FP30939 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR1FP30939 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR1FP30939 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR1FP30939 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR1FP30939 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR1FP30939 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR1FP30939 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR1FP30939 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR1FP30939 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms