Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SDSP20132 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SDSP20132 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SDSP20132 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SDSP20132 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SDSP20132 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SDSP20132 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SDSP20132 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SDSP20132 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SDSP20132 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SDSP20132 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SDSP20132 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SDSP20132 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SDSP20132 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SDSP20132 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SDSP20132 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SDSP20132 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SDSP20132 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SDSP20132 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SDSP20132 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SDSP20132 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SDSP20132 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SDSP20132 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SDSP20132 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SDSP20132 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SDSP20132 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SDSP20132 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SDSP20132 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SDSP20132 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SDSP20132 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SDSP20132 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SDSP20132 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SDSP20132 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SDSP20132 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SDSP20132 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SDSP20132 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SDSP20132 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SDSP20132 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SDSP20132 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SDSP20132 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SDSP20132 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SDSP20132 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SDSP20132 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SDSP20132 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SDSP20132 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SDSP20132 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SDSP20132 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SDSP20132 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SDSP20132 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SDSP20132 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SDSP20132 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SDSP20132 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SDSP20132 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SDSP20132 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SDSP20132 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SDSP20132 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SDSP20132 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SDSP20132 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SDSP20132 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SDSP20132 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SDSP20132 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SDSP20132 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SDSP20132 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SDSP20132 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SDSP20132 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SDSP20132 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SDSP20132 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SDSP20132 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SDSP20132 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SDSP20132 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SDSP20132 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SDSP20132 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SDSP20132 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SDSP20132 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SDSP20132 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SDSP20132 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SDSP20132 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SDSP20132 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SDSP20132 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SDSP20132 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SDSP20132 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SDSP20132 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SDSP20132 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SDSP20132 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SDSP20132 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SDSP20132 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SDSP20132 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SDSP20132 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SDSP20132 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SDSP20132 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SDSP20132 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SDSP20132 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SDSP20132 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SDSP20132 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SDSP20132 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SDSP20132 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SDSP20132 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SDSP20132 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SDSP20132 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SDSP20132 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms