Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPL17P18621 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPL17P18621 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RPL17P18621 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RPL17P18621 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RPL17P18621 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPL17P18621 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RPL17P18621 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPL17P18621 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPL17P18621 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPL17P18621 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPL17P18621 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPL17P18621 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPL17P18621 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPL17P18621 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RPL17P18621 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPL17P18621 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPL17P18621 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPL17P18621 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPL17P18621 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPL17P18621 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPL17P18621 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPL17P18621 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPL17P18621 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPL17P18621 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPL17P18621 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPL17P18621 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPL17P18621 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPL17P18621 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPL17P18621 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPL17P18621 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPL17P18621 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPL17P18621 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPL17P18621 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPL17P18621 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RPL17P18621 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RPL17P18621 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RPL17P18621 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPL17P18621 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPL17P18621 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RPL17P18621 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPL17P18621 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPL17P18621 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPL17P18621 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPL17P18621 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPL17P18621 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPL17P18621 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPL17P18621 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPL17P18621 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPL17P18621 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RPL17P18621 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPL17P18621 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPL17P18621 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPL17P18621 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPL17P18621 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPL17P18621 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPL17P18621 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPL17P18621 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPL17P18621 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPL17P18621 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
RPL17P18621 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPL17P18621 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPL17P18621 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPL17P18621 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPL17P18621 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPL17P18621 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPL17P18621 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPL17P18621 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPL17P18621 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPL17P18621 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPL17P18621 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPL17P18621 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPL17P18621 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPL17P18621 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RPL17P18621 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPL17P18621 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPL17P18621 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPL17P18621 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPL17P18621 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPL17P18621 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPL17P18621 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPL17P18621 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPL17P18621 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPL17P18621 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPL17P18621 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPL17P18621 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPL17P18621 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RPL17P18621 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPL17P18621 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPL17P18621 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPL17P18621 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPL17P18621 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPL17P18621 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPL17P18621 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPL17P18621 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPL17P18621 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPL17P18621 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPL17P18621 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPL17P18621 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPL17P18621 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms