Protein–RNA interactions for Protein: P13473

LAMP2, Lysosome-associated membrane glycoprotein 2, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP2P13473 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMP2P13473 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMP2P13473 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMP2P13473 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMP2P13473 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMP2P13473 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMP2P13473 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMP2P13473 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMP2P13473 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMP2P13473 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMP2P13473 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMP2P13473 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMP2P13473 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMP2P13473 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMP2P13473 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMP2P13473 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMP2P13473 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMP2P13473 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMP2P13473 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMP2P13473 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMP2P13473 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMP2P13473 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMP2P13473 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMP2P13473 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMP2P13473 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMP2P13473 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMP2P13473 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMP2P13473 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMP2P13473 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMP2P13473 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMP2P13473 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMP2P13473 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMP2P13473 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMP2P13473 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMP2P13473 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMP2P13473 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMP2P13473 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMP2P13473 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMP2P13473 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMP2P13473 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMP2P13473 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMP2P13473 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LAMP2P13473 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMP2P13473 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMP2P13473 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMP2P13473 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMP2P13473 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LAMP2P13473 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMP2P13473 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LAMP2P13473 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMP2P13473 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMP2P13473 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMP2P13473 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMP2P13473 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMP2P13473 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMP2P13473 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMP2P13473 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMP2P13473 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMP2P13473 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMP2P13473 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMP2P13473 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMP2P13473 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMP2P13473 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMP2P13473 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMP2P13473 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMP2P13473 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMP2P13473 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMP2P13473 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMP2P13473 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMP2P13473 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMP2P13473 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMP2P13473 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMP2P13473 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMP2P13473 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMP2P13473 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMP2P13473 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMP2P13473 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMP2P13473 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMP2P13473 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMP2P13473 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMP2P13473 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMP2P13473 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMP2P13473 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMP2P13473 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMP2P13473 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMP2P13473 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMP2P13473 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMP2P13473 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMP2P13473 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMP2P13473 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMP2P13473 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMP2P13473 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMP2P13473 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMP2P13473 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMP2P13473 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMP2P13473 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMP2P13473 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMP2P13473 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMP2P13473 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMP2P13473 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms