Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MMP3P08254 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
MMP3P08254 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MMP3P08254 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MMP3P08254 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MMP3P08254 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP3P08254 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP3P08254 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP3P08254 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP3P08254 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP3P08254 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMP3P08254 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMP3P08254 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMP3P08254 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMP3P08254 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMP3P08254 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMP3P08254 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMP3P08254 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MMP3P08254 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MMP3P08254 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MMP3P08254 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MMP3P08254 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MMP3P08254 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MMP3P08254 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MMP3P08254 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MMP3P08254 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MMP3P08254 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MMP3P08254 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MMP3P08254 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MMP3P08254 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MMP3P08254 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MMP3P08254 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MMP3P08254 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MMP3P08254 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MMP3P08254 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MMP3P08254 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MMP3P08254 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MMP3P08254 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MMP3P08254 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MMP3P08254 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MMP3P08254 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MMP3P08254 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MMP3P08254 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MMP3P08254 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MMP3P08254 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MMP3P08254 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MMP3P08254 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MMP3P08254 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MMP3P08254 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MMP3P08254 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MMP3P08254 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MMP3P08254 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MMP3P08254 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MMP3P08254 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MMP3P08254 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MMP3P08254 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MMP3P08254 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MMP3P08254 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MMP3P08254 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MMP3P08254 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MMP3P08254 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
MMP3P08254 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MMP3P08254 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
MMP3P08254 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MMP3P08254 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MMP3P08254 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MMP3P08254 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MMP3P08254 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MMP3P08254 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MMP3P08254 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MMP3P08254 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MMP3P08254 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MMP3P08254 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MMP3P08254 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MMP3P08254 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MMP3P08254 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MMP3P08254 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MMP3P08254 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MMP3P08254 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MMP3P08254 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP3P08254 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP3P08254 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP3P08254 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP3P08254 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP3P08254 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP3P08254 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP3P08254 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP3P08254 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP3P08254 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP3P08254 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MMP3P08254 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MMP3P08254 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MMP3P08254 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MMP3P08254 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MMP3P08254 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MMP3P08254 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MMP3P08254 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MMP3P08254 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MMP3P08254 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MMP3P08254 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms