Protein–RNA interactions for Protein: P01880

IGHD, Immunoglobulin heavy constant delta, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHDP01880 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
IGHDP01880 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
IGHDP01880 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
IGHDP01880 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
IGHDP01880 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
IGHDP01880 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
IGHDP01880 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
IGHDP01880 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
IGHDP01880 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
IGHDP01880 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
IGHDP01880 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
IGHDP01880 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
IGHDP01880 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
IGHDP01880 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
IGHDP01880 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
IGHDP01880 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
IGHDP01880 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
IGHDP01880 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
IGHDP01880 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
IGHDP01880 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
IGHDP01880 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
IGHDP01880 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
IGHDP01880 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
IGHDP01880 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
IGHDP01880 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
IGHDP01880 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
IGHDP01880 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
IGHDP01880 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
IGHDP01880 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
IGHDP01880 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
IGHDP01880 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
IGHDP01880 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
IGHDP01880 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
IGHDP01880 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
IGHDP01880 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
IGHDP01880 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
IGHDP01880 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
IGHDP01880 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
IGHDP01880 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
IGHDP01880 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
IGHDP01880 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
IGHDP01880 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
IGHDP01880 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
IGHDP01880 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
IGHDP01880 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
IGHDP01880 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
IGHDP01880 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
IGHDP01880 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
IGHDP01880 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
IGHDP01880 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
IGHDP01880 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
IGHDP01880 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
IGHDP01880 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
IGHDP01880 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
IGHDP01880 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
IGHDP01880 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
IGHDP01880 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
IGHDP01880 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
IGHDP01880 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
IGHDP01880 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
IGHDP01880 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
IGHDP01880 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
IGHDP01880 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
IGHDP01880 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
IGHDP01880 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
IGHDP01880 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
IGHDP01880 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
IGHDP01880 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
IGHDP01880 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
IGHDP01880 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
IGHDP01880 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
IGHDP01880 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
IGHDP01880 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
IGHDP01880 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
IGHDP01880 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
IGHDP01880 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
IGHDP01880 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
IGHDP01880 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
IGHDP01880 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
IGHDP01880 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
IGHDP01880 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
IGHDP01880 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
IGHDP01880 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
IGHDP01880 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
IGHDP01880 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
IGHDP01880 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
IGHDP01880 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
IGHDP01880 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
IGHDP01880 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
IGHDP01880 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
IGHDP01880 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
IGHDP01880 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30■■■□□ 2.39
IGHDP01880 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
IGHDP01880 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
IGHDP01880 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
IGHDP01880 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
IGHDP01880 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
IGHDP01880 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
IGHDP01880 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
IGHDP01880 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms