Protein–RNA interactions for Protein: O94876

TMCC1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC1O94876 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCC1O94876 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCC1O94876 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCC1O94876 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCC1O94876 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMCC1O94876 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMCC1O94876 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMCC1O94876 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMCC1O94876 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMCC1O94876 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMCC1O94876 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMCC1O94876 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMCC1O94876 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMCC1O94876 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCC1O94876 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCC1O94876 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCC1O94876 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCC1O94876 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCC1O94876 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCC1O94876 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCC1O94876 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCC1O94876 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCC1O94876 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMCC1O94876 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMCC1O94876 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMCC1O94876 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMCC1O94876 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMCC1O94876 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCC1O94876 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCC1O94876 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCC1O94876 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCC1O94876 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCC1O94876 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCC1O94876 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCC1O94876 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMCC1O94876 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMCC1O94876 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMCC1O94876 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMCC1O94876 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMCC1O94876 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMCC1O94876 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMCC1O94876 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMCC1O94876 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMCC1O94876 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMCC1O94876 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMCC1O94876 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMCC1O94876 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMCC1O94876 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMCC1O94876 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCC1O94876 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCC1O94876 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCC1O94876 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCC1O94876 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCC1O94876 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCC1O94876 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCC1O94876 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCC1O94876 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCC1O94876 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCC1O94876 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCC1O94876 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCC1O94876 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMCC1O94876 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMCC1O94876 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMCC1O94876 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMCC1O94876 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMCC1O94876 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMCC1O94876 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCC1O94876 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCC1O94876 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCC1O94876 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCC1O94876 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCC1O94876 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCC1O94876 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCC1O94876 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCC1O94876 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCC1O94876 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMCC1O94876 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMCC1O94876 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMCC1O94876 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TMCC1O94876 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMCC1O94876 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMCC1O94876 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
TMCC1O94876 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms