Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
STX6O43752 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
STX6O43752 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
STX6O43752 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
STX6O43752 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
STX6O43752 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
STX6O43752 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STX6O43752 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STX6O43752 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STX6O43752 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STX6O43752 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STX6O43752 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STX6O43752 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STX6O43752 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STX6O43752 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
STX6O43752 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STX6O43752 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STX6O43752 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STX6O43752 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STX6O43752 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STX6O43752 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STX6O43752 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STX6O43752 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STX6O43752 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STX6O43752 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STX6O43752 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
STX6O43752 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
STX6O43752 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
STX6O43752 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
STX6O43752 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STX6O43752 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
STX6O43752 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
STX6O43752 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
STX6O43752 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
STX6O43752 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
STX6O43752 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
STX6O43752 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
STX6O43752 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
STX6O43752 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
STX6O43752 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
STX6O43752 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
STX6O43752 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
STX6O43752 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STX6O43752 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STX6O43752 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STX6O43752 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STX6O43752 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STX6O43752 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STX6O43752 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STX6O43752 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STX6O43752 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
STX6O43752 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
STX6O43752 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STX6O43752 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
STX6O43752 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
STX6O43752 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
STX6O43752 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
STX6O43752 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
STX6O43752 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
STX6O43752 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
STX6O43752 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
STX6O43752 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
STX6O43752 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
STX6O43752 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STX6O43752 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STX6O43752 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
STX6O43752 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
STX6O43752 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
STX6O43752 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
STX6O43752 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
STX6O43752 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
STX6O43752 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
STX6O43752 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
STX6O43752 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
STX6O43752 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
STX6O43752 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
STX6O43752 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
STX6O43752 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
STX6O43752 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
STX6O43752 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
STX6O43752 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
STX6O43752 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
STX6O43752 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
STX6O43752 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
STX6O43752 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
STX6O43752 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
STX6O43752 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
STX6O43752 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
STX6O43752 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
STX6O43752 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
STX6O43752 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
STX6O43752 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
STX6O43752 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
STX6O43752 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
STX6O43752 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
STX6O43752 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
STX6O43752 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
STX6O43752 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
STX6O43752 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
STX6O43752 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms