Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTRA2O43464 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTRA2O43464 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTRA2O43464 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTRA2O43464 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTRA2O43464 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HTRA2O43464 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTRA2O43464 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTRA2O43464 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTRA2O43464 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTRA2O43464 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTRA2O43464 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HTRA2O43464 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTRA2O43464 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTRA2O43464 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HTRA2O43464 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTRA2O43464 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTRA2O43464 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTRA2O43464 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTRA2O43464 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTRA2O43464 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HTRA2O43464 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTRA2O43464 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HTRA2O43464 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTRA2O43464 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTRA2O43464 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTRA2O43464 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTRA2O43464 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTRA2O43464 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTRA2O43464 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HTRA2O43464 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTRA2O43464 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTRA2O43464 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTRA2O43464 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTRA2O43464 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTRA2O43464 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTRA2O43464 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTRA2O43464 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTRA2O43464 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTRA2O43464 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTRA2O43464 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTRA2O43464 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTRA2O43464 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTRA2O43464 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTRA2O43464 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTRA2O43464 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTRA2O43464 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTRA2O43464 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms