Protein–RNA interactions for Protein: O43280

TREH, Trehalase, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREHO43280 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TREHO43280 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TREHO43280 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TREHO43280 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TREHO43280 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TREHO43280 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TREHO43280 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TREHO43280 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
TREHO43280 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TREHO43280 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TREHO43280 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TREHO43280 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TREHO43280 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TREHO43280 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TREHO43280 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TREHO43280 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TREHO43280 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TREHO43280 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TREHO43280 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TREHO43280 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TREHO43280 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TREHO43280 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TREHO43280 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TREHO43280 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TREHO43280 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TREHO43280 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TREHO43280 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TREHO43280 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TREHO43280 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TREHO43280 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TREHO43280 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TREHO43280 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TREHO43280 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TREHO43280 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TREHO43280 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TREHO43280 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TREHO43280 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TREHO43280 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TREHO43280 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TREHO43280 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TREHO43280 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TREHO43280 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TREHO43280 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TREHO43280 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TREHO43280 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TREHO43280 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TREHO43280 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TREHO43280 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TREHO43280 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TREHO43280 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TREHO43280 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TREHO43280 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TREHO43280 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TREHO43280 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TREHO43280 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TREHO43280 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TREHO43280 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TREHO43280 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TREHO43280 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TREHO43280 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TREHO43280 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TREHO43280 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TREHO43280 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TREHO43280 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TREHO43280 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TREHO43280 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TREHO43280 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TREHO43280 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TREHO43280 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TREHO43280 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TREHO43280 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TREHO43280 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TREHO43280 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TREHO43280 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TREHO43280 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TREHO43280 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TREHO43280 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TREHO43280 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TREHO43280 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TREHO43280 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TREHO43280 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TREHO43280 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TREHO43280 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TREHO43280 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TREHO43280 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TREHO43280 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TREHO43280 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TREHO43280 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TREHO43280 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TREHO43280 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TREHO43280 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TREHO43280 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TREHO43280 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TREHO43280 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TREHO43280 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TREHO43280 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TREHO43280 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TREHO43280 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TREHO43280 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TREHO43280 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms