Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXC11O43248 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXC11O43248 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXC11O43248 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXC11O43248 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXC11O43248 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXC11O43248 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXC11O43248 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXC11O43248 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXC11O43248 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXC11O43248 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXC11O43248 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXC11O43248 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXC11O43248 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXC11O43248 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXC11O43248 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXC11O43248 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXC11O43248 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXC11O43248 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXC11O43248 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXC11O43248 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXC11O43248 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXC11O43248 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXC11O43248 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC11O43248 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC11O43248 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC11O43248 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC11O43248 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC11O43248 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC11O43248 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC11O43248 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC11O43248 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC11O43248 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXC11O43248 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXC11O43248 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXC11O43248 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXC11O43248 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXC11O43248 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXC11O43248 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXC11O43248 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXC11O43248 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXC11O43248 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXC11O43248 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXC11O43248 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXC11O43248 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXC11O43248 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXC11O43248 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXC11O43248 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXC11O43248 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXC11O43248 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXC11O43248 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC11O43248 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC11O43248 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC11O43248 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC11O43248 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXC11O43248 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXC11O43248 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXC11O43248 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXC11O43248 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXC11O43248 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXC11O43248 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXC11O43248 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXC11O43248 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC11O43248 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC11O43248 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC11O43248 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXC11O43248 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXC11O43248 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXC11O43248 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXC11O43248 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXC11O43248 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXC11O43248 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXC11O43248 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXC11O43248 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXC11O43248 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXC11O43248 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXC11O43248 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HOXC11O43248 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC11O43248 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC11O43248 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC11O43248 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC11O43248 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC11O43248 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC11O43248 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC11O43248 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC11O43248 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC11O43248 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC11O43248 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC11O43248 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC11O43248 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC11O43248 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC11O43248 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC11O43248 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC11O43248 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXC11O43248 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXC11O43248 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXC11O43248 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC11O43248 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC11O43248 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC11O43248 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms