Protein–RNA interactions for Protein: O15379

HDAC3, Histone deacetylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3O15379 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC3O15379 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
HDAC3O15379 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC3O15379 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC3O15379 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC3O15379 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC3O15379 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC3O15379 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC3O15379 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC3O15379 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC3O15379 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC3O15379 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC3O15379 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC3O15379 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC3O15379 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC3O15379 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC3O15379 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC3O15379 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC3O15379 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC3O15379 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC3O15379 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC3O15379 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC3O15379 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC3O15379 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC3O15379 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC3O15379 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC3O15379 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC3O15379 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC3O15379 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC3O15379 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC3O15379 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC3O15379 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.1 ms