Protein–RNA interactions for Protein: O15212

PFDN6, Prefoldin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN6O15212 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PFDN6O15212 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PFDN6O15212 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PFDN6O15212 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PFDN6O15212 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PFDN6O15212 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PFDN6O15212 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PFDN6O15212 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PFDN6O15212 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PFDN6O15212 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PFDN6O15212 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PFDN6O15212 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PFDN6O15212 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PFDN6O15212 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PFDN6O15212 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PFDN6O15212 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PFDN6O15212 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PFDN6O15212 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PFDN6O15212 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PFDN6O15212 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PFDN6O15212 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PFDN6O15212 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PFDN6O15212 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PFDN6O15212 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PFDN6O15212 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PFDN6O15212 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PFDN6O15212 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PFDN6O15212 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PFDN6O15212 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PFDN6O15212 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PFDN6O15212 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PFDN6O15212 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PFDN6O15212 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PFDN6O15212 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PFDN6O15212 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PFDN6O15212 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PFDN6O15212 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PFDN6O15212 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PFDN6O15212 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PFDN6O15212 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PFDN6O15212 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PFDN6O15212 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PFDN6O15212 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PFDN6O15212 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PFDN6O15212 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PFDN6O15212 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PFDN6O15212 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PFDN6O15212 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PFDN6O15212 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PFDN6O15212 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PFDN6O15212 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PFDN6O15212 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PFDN6O15212 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PFDN6O15212 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PFDN6O15212 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PFDN6O15212 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PFDN6O15212 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PFDN6O15212 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PFDN6O15212 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PFDN6O15212 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PFDN6O15212 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PFDN6O15212 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PFDN6O15212 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PFDN6O15212 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PFDN6O15212 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PFDN6O15212 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PFDN6O15212 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PFDN6O15212 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PFDN6O15212 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PFDN6O15212 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PFDN6O15212 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PFDN6O15212 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PFDN6O15212 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PFDN6O15212 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PFDN6O15212 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PFDN6O15212 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PFDN6O15212 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PFDN6O15212 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PFDN6O15212 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PFDN6O15212 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PFDN6O15212 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PFDN6O15212 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PFDN6O15212 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PFDN6O15212 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PFDN6O15212 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PFDN6O15212 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PFDN6O15212 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PFDN6O15212 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PFDN6O15212 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PFDN6O15212 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PFDN6O15212 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PFDN6O15212 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PFDN6O15212 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PFDN6O15212 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PFDN6O15212 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PFDN6O15212 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PFDN6O15212 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PFDN6O15212 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PFDN6O15212 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PFDN6O15212 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms