Protein–RNA interactions for Protein: O14958

CASQ2, Calsequestrin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ2O14958 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASQ2O14958 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASQ2O14958 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASQ2O14958 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASQ2O14958 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASQ2O14958 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CASQ2O14958 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASQ2O14958 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CASQ2O14958 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASQ2O14958 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASQ2O14958 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASQ2O14958 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASQ2O14958 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASQ2O14958 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASQ2O14958 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASQ2O14958 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASQ2O14958 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASQ2O14958 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASQ2O14958 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASQ2O14958 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASQ2O14958 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASQ2O14958 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASQ2O14958 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CASQ2O14958 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASQ2O14958 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASQ2O14958 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASQ2O14958 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASQ2O14958 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASQ2O14958 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASQ2O14958 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASQ2O14958 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASQ2O14958 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASQ2O14958 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASQ2O14958 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASQ2O14958 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASQ2O14958 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASQ2O14958 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASQ2O14958 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASQ2O14958 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASQ2O14958 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASQ2O14958 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASQ2O14958 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASQ2O14958 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASQ2O14958 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASQ2O14958 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASQ2O14958 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASQ2O14958 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASQ2O14958 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASQ2O14958 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CASQ2O14958 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CASQ2O14958 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASQ2O14958 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASQ2O14958 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASQ2O14958 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASQ2O14958 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CASQ2O14958 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASQ2O14958 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASQ2O14958 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASQ2O14958 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASQ2O14958 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASQ2O14958 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASQ2O14958 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASQ2O14958 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASQ2O14958 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASQ2O14958 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASQ2O14958 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASQ2O14958 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASQ2O14958 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASQ2O14958 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASQ2O14958 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CASQ2O14958 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASQ2O14958 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASQ2O14958 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASQ2O14958 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASQ2O14958 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASQ2O14958 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASQ2O14958 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASQ2O14958 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASQ2O14958 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASQ2O14958 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASQ2O14958 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASQ2O14958 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASQ2O14958 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASQ2O14958 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASQ2O14958 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASQ2O14958 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASQ2O14958 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASQ2O14958 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASQ2O14958 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASQ2O14958 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASQ2O14958 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASQ2O14958 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASQ2O14958 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASQ2O14958 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASQ2O14958 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASQ2O14958 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASQ2O14958 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASQ2O14958 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASQ2O14958 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASQ2O14958 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms