Protein–RNA interactions for Protein: O14562

UBFD1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBFD1O14562 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBFD1O14562 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBFD1O14562 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBFD1O14562 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UBFD1O14562 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UBFD1O14562 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBFD1O14562 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBFD1O14562 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBFD1O14562 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBFD1O14562 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBFD1O14562 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBFD1O14562 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBFD1O14562 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBFD1O14562 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBFD1O14562 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBFD1O14562 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBFD1O14562 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBFD1O14562 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBFD1O14562 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
UBFD1O14562 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBFD1O14562 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBFD1O14562 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBFD1O14562 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBFD1O14562 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBFD1O14562 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBFD1O14562 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBFD1O14562 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBFD1O14562 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBFD1O14562 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBFD1O14562 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBFD1O14562 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBFD1O14562 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBFD1O14562 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBFD1O14562 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBFD1O14562 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBFD1O14562 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBFD1O14562 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBFD1O14562 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBFD1O14562 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBFD1O14562 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBFD1O14562 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBFD1O14562 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBFD1O14562 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBFD1O14562 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBFD1O14562 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBFD1O14562 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBFD1O14562 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBFD1O14562 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBFD1O14562 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBFD1O14562 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBFD1O14562 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBFD1O14562 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBFD1O14562 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBFD1O14562 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBFD1O14562 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBFD1O14562 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBFD1O14562 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBFD1O14562 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
UBFD1O14562 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBFD1O14562 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBFD1O14562 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBFD1O14562 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
UBFD1O14562 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBFD1O14562 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBFD1O14562 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
UBFD1O14562 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBFD1O14562 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBFD1O14562 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBFD1O14562 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBFD1O14562 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBFD1O14562 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBFD1O14562 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBFD1O14562 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBFD1O14562 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBFD1O14562 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBFD1O14562 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBFD1O14562 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBFD1O14562 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBFD1O14562 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBFD1O14562 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBFD1O14562 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBFD1O14562 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBFD1O14562 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBFD1O14562 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBFD1O14562 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBFD1O14562 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBFD1O14562 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBFD1O14562 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBFD1O14562 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBFD1O14562 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBFD1O14562 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBFD1O14562 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBFD1O14562 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBFD1O14562 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBFD1O14562 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBFD1O14562 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBFD1O14562 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBFD1O14562 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBFD1O14562 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBFD1O14562 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms