Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GFRA2O00451 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GFRA2O00451 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GFRA2O00451 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GFRA2O00451 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GFRA2O00451 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GFRA2O00451 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GFRA2O00451 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GFRA2O00451 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GFRA2O00451 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GFRA2O00451 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GFRA2O00451 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GFRA2O00451 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GFRA2O00451 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GFRA2O00451 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GFRA2O00451 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GFRA2O00451 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GFRA2O00451 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GFRA2O00451 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GFRA2O00451 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GFRA2O00451 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GFRA2O00451 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GFRA2O00451 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GFRA2O00451 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GFRA2O00451 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GFRA2O00451 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GFRA2O00451 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GFRA2O00451 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GFRA2O00451 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GFRA2O00451 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GFRA2O00451 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GFRA2O00451 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GFRA2O00451 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GFRA2O00451 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GFRA2O00451 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GFRA2O00451 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GFRA2O00451 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GFRA2O00451 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GFRA2O00451 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GFRA2O00451 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GFRA2O00451 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GFRA2O00451 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GFRA2O00451 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GFRA2O00451 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GFRA2O00451 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GFRA2O00451 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GFRA2O00451 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GFRA2O00451 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GFRA2O00451 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GFRA2O00451 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GFRA2O00451 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GFRA2O00451 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GFRA2O00451 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GFRA2O00451 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GFRA2O00451 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GFRA2O00451 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GFRA2O00451 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GFRA2O00451 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GFRA2O00451 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GFRA2O00451 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GFRA2O00451 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GFRA2O00451 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GFRA2O00451 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GFRA2O00451 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GFRA2O00451 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GFRA2O00451 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GFRA2O00451 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GFRA2O00451 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GFRA2O00451 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GFRA2O00451 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GFRA2O00451 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GFRA2O00451 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GFRA2O00451 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GFRA2O00451 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GFRA2O00451 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GFRA2O00451 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GFRA2O00451 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GFRA2O00451 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GFRA2O00451 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GFRA2O00451 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GFRA2O00451 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GFRA2O00451 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GFRA2O00451 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GFRA2O00451 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GFRA2O00451 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GFRA2O00451 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GFRA2O00451 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GFRA2O00451 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GFRA2O00451 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GFRA2O00451 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GFRA2O00451 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GFRA2O00451 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GFRA2O00451 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GFRA2O00451 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GFRA2O00451 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GFRA2O00451 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GFRA2O00451 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GFRA2O00451 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GFRA2O00451 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GFRA2O00451 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms