Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
E9PCH4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
E9PCH4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
E9PCH4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
E9PCH4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
E9PCH4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
E9PCH4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
E9PCH4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
E9PCH4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
E9PCH4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC35.45■■■■□ 3.27
E9PCH4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC35.45■■■■□ 3.26
E9PCH4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
E9PCH4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
E9PCH4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
E9PCH4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
E9PCH4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
E9PCH4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
E9PCH4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
E9PCH4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
E9PCH4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
E9PCH4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
E9PCH4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
E9PCH4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
E9PCH4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
E9PCH4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
E9PCH4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
E9PCH4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
E9PCH4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
E9PCH4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
E9PCH4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
E9PCH4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
E9PCH4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
E9PCH4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
E9PCH4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
E9PCH4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
E9PCH4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
E9PCH4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
E9PCH4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
E9PCH4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
E9PCH4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
E9PCH4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
E9PCH4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
E9PCH4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
E9PCH4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
E9PCH4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
E9PCH4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
E9PCH4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
E9PCH4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
E9PCH4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
E9PCH4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
E9PCH4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
E9PCH4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
E9PCH4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
E9PCH4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
E9PCH4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
E9PCH4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
E9PCH4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
E9PCH4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
E9PCH4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
E9PCH4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
E9PCH4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
E9PCH4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
E9PCH4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
E9PCH4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
E9PCH4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
E9PCH4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
E9PCH4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
E9PCH4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
E9PCH4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
E9PCH4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
E9PCH4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
E9PCH4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
E9PCH4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
E9PCH4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
E9PCH4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
E9PCH4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
E9PCH4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
E9PCH4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
E9PCH4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
E9PCH4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
E9PCH4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
E9PCH4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
E9PCH4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
E9PCH4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
E9PCH4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
E9PCH4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
E9PCH4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
E9PCH4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
E9PCH4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
E9PCH4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
E9PCH4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
E9PCH4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
E9PCH4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
E9PCH4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
E9PCH4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
E9PCH4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
E9PCH4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
E9PCH4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
E9PCH4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
E9PCH4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms