Protein–RNA interactions for Protein: A8MTJ6

FOXI3, Forkhead box protein I3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI3A8MTJ6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXI3A8MTJ6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXI3A8MTJ6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXI3A8MTJ6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXI3A8MTJ6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXI3A8MTJ6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXI3A8MTJ6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXI3A8MTJ6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXI3A8MTJ6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXI3A8MTJ6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXI3A8MTJ6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXI3A8MTJ6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXI3A8MTJ6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXI3A8MTJ6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXI3A8MTJ6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXI3A8MTJ6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXI3A8MTJ6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXI3A8MTJ6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXI3A8MTJ6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXI3A8MTJ6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXI3A8MTJ6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXI3A8MTJ6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXI3A8MTJ6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms