Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GOLGA6CA6NDK9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms