Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL33A6NCF5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL33A6NCF5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL33A6NCF5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL33A6NCF5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL33A6NCF5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms