Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW3

ABT1, Activator of basal transcription 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABT1Q9ULW3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABT1Q9ULW3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABT1Q9ULW3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABT1Q9ULW3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABT1Q9ULW3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABT1Q9ULW3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABT1Q9ULW3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABT1Q9ULW3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABT1Q9ULW3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABT1Q9ULW3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABT1Q9ULW3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABT1Q9ULW3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABT1Q9ULW3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABT1Q9ULW3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABT1Q9ULW3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABT1Q9ULW3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABT1Q9ULW3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABT1Q9ULW3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABT1Q9ULW3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABT1Q9ULW3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABT1Q9ULW3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABT1Q9ULW3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABT1Q9ULW3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ABT1Q9ULW3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABT1Q9ULW3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ABT1Q9ULW3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABT1Q9ULW3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABT1Q9ULW3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABT1Q9ULW3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABT1Q9ULW3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABT1Q9ULW3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABT1Q9ULW3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABT1Q9ULW3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ABT1Q9ULW3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABT1Q9ULW3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABT1Q9ULW3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABT1Q9ULW3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ABT1Q9ULW3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ABT1Q9ULW3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABT1Q9ULW3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABT1Q9ULW3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ABT1Q9ULW3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABT1Q9ULW3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ABT1Q9ULW3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABT1Q9ULW3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABT1Q9ULW3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ABT1Q9ULW3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABT1Q9ULW3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABT1Q9ULW3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABT1Q9ULW3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABT1Q9ULW3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABT1Q9ULW3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ABT1Q9ULW3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABT1Q9ULW3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABT1Q9ULW3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABT1Q9ULW3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABT1Q9ULW3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABT1Q9ULW3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ABT1Q9ULW3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ABT1Q9ULW3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ABT1Q9ULW3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ABT1Q9ULW3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ABT1Q9ULW3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABT1Q9ULW3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABT1Q9ULW3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABT1Q9ULW3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABT1Q9ULW3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ABT1Q9ULW3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ABT1Q9ULW3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ABT1Q9ULW3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ABT1Q9ULW3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ABT1Q9ULW3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ABT1Q9ULW3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ABT1Q9ULW3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ABT1Q9ULW3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ABT1Q9ULW3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ABT1Q9ULW3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ABT1Q9ULW3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ABT1Q9ULW3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ABT1Q9ULW3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABT1Q9ULW3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABT1Q9ULW3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABT1Q9ULW3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ABT1Q9ULW3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ABT1Q9ULW3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABT1Q9ULW3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABT1Q9ULW3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABT1Q9ULW3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABT1Q9ULW3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABT1Q9ULW3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABT1Q9ULW3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABT1Q9ULW3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABT1Q9ULW3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABT1Q9ULW3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ABT1Q9ULW3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ABT1Q9ULW3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ABT1Q9ULW3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ABT1Q9ULW3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ABT1Q9ULW3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ABT1Q9ULW3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms