Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CDH7Q9ULB5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDH7Q9ULB5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH7Q9ULB5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH7Q9ULB5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH7Q9ULB5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH7Q9ULB5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH7Q9ULB5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH7Q9ULB5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH7Q9ULB5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH7Q9ULB5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDH7Q9ULB5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDH7Q9ULB5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDH7Q9ULB5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDH7Q9ULB5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDH7Q9ULB5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDH7Q9ULB5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDH7Q9ULB5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDH7Q9ULB5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CDH7Q9ULB5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH7Q9ULB5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH7Q9ULB5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH7Q9ULB5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH7Q9ULB5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH7Q9ULB5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH7Q9ULB5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH7Q9ULB5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH7Q9ULB5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH7Q9ULB5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH7Q9ULB5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH7Q9ULB5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH7Q9ULB5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH7Q9ULB5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH7Q9ULB5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH7Q9ULB5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH7Q9ULB5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH7Q9ULB5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH7Q9ULB5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH7Q9ULB5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH7Q9ULB5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDH7Q9ULB5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDH7Q9ULB5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDH7Q9ULB5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDH7Q9ULB5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDH7Q9ULB5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH7Q9ULB5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH7Q9ULB5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH7Q9ULB5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH7Q9ULB5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH7Q9ULB5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH7Q9ULB5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH7Q9ULB5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH7Q9ULB5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH7Q9ULB5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH7Q9ULB5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH7Q9ULB5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH7Q9ULB5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH7Q9ULB5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH7Q9ULB5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH7Q9ULB5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH7Q9ULB5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH7Q9ULB5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH7Q9ULB5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH7Q9ULB5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH7Q9ULB5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH7Q9ULB5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH7Q9ULB5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH7Q9ULB5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH7Q9ULB5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH7Q9ULB5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH7Q9ULB5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH7Q9ULB5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH7Q9ULB5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH7Q9ULB5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH7Q9ULB5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH7Q9ULB5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH7Q9ULB5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH7Q9ULB5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH7Q9ULB5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH7Q9ULB5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH7Q9ULB5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH7Q9ULB5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH7Q9ULB5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH7Q9ULB5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH7Q9ULB5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH7Q9ULB5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH7Q9ULB5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH7Q9ULB5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH7Q9ULB5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH7Q9ULB5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH7Q9ULB5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH7Q9ULB5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH7Q9ULB5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH7Q9ULB5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH7Q9ULB5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH7Q9ULB5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CDH7Q9ULB5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH7Q9ULB5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH7Q9ULB5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH7Q9ULB5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms