Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SAE1Q9UBE0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SAE1Q9UBE0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SAE1Q9UBE0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SAE1Q9UBE0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SAE1Q9UBE0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SAE1Q9UBE0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SAE1Q9UBE0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SAE1Q9UBE0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SAE1Q9UBE0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SAE1Q9UBE0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SAE1Q9UBE0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SAE1Q9UBE0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SAE1Q9UBE0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SAE1Q9UBE0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SAE1Q9UBE0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAE1Q9UBE0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAE1Q9UBE0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAE1Q9UBE0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAE1Q9UBE0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAE1Q9UBE0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAE1Q9UBE0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAE1Q9UBE0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAE1Q9UBE0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SAE1Q9UBE0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SAE1Q9UBE0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SAE1Q9UBE0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SAE1Q9UBE0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SAE1Q9UBE0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SAE1Q9UBE0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SAE1Q9UBE0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SAE1Q9UBE0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SAE1Q9UBE0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SAE1Q9UBE0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SAE1Q9UBE0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SAE1Q9UBE0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SAE1Q9UBE0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SAE1Q9UBE0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAE1Q9UBE0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAE1Q9UBE0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAE1Q9UBE0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAE1Q9UBE0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAE1Q9UBE0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SAE1Q9UBE0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SAE1Q9UBE0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SAE1Q9UBE0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAE1Q9UBE0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAE1Q9UBE0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAE1Q9UBE0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAE1Q9UBE0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAE1Q9UBE0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAE1Q9UBE0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAE1Q9UBE0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAE1Q9UBE0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAE1Q9UBE0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAE1Q9UBE0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAE1Q9UBE0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SAE1Q9UBE0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAE1Q9UBE0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAE1Q9UBE0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAE1Q9UBE0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAE1Q9UBE0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAE1Q9UBE0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAE1Q9UBE0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAE1Q9UBE0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SAE1Q9UBE0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SAE1Q9UBE0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SAE1Q9UBE0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SAE1Q9UBE0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAE1Q9UBE0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAE1Q9UBE0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAE1Q9UBE0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SAE1Q9UBE0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms