Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED17Q9NVC6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED17Q9NVC6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED17Q9NVC6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED17Q9NVC6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED17Q9NVC6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MED17Q9NVC6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED17Q9NVC6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED17Q9NVC6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED17Q9NVC6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED17Q9NVC6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED17Q9NVC6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED17Q9NVC6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED17Q9NVC6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED17Q9NVC6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED17Q9NVC6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED17Q9NVC6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED17Q9NVC6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED17Q9NVC6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED17Q9NVC6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MED17Q9NVC6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED17Q9NVC6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED17Q9NVC6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED17Q9NVC6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED17Q9NVC6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED17Q9NVC6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED17Q9NVC6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MED17Q9NVC6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MED17Q9NVC6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED17Q9NVC6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED17Q9NVC6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED17Q9NVC6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED17Q9NVC6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED17Q9NVC6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED17Q9NVC6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED17Q9NVC6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED17Q9NVC6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED17Q9NVC6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED17Q9NVC6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED17Q9NVC6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED17Q9NVC6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms