Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCF3Q9NUQ8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCF3Q9NUQ8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCF3Q9NUQ8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCF3Q9NUQ8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCF3Q9NUQ8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCF3Q9NUQ8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCF3Q9NUQ8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCF3Q9NUQ8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCF3Q9NUQ8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCF3Q9NUQ8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCF3Q9NUQ8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCF3Q9NUQ8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCF3Q9NUQ8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCF3Q9NUQ8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCF3Q9NUQ8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCF3Q9NUQ8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCF3Q9NUQ8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCF3Q9NUQ8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCF3Q9NUQ8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCF3Q9NUQ8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCF3Q9NUQ8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCF3Q9NUQ8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCF3Q9NUQ8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCF3Q9NUQ8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCF3Q9NUQ8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCF3Q9NUQ8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCF3Q9NUQ8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCF3Q9NUQ8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms