Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SAMSN1Q9NSI8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SAMSN1Q9NSI8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SAMSN1Q9NSI8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SAMSN1Q9NSI8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SAMSN1Q9NSI8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SAMSN1Q9NSI8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SAMSN1Q9NSI8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SAMSN1Q9NSI8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SAMSN1Q9NSI8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SAMSN1Q9NSI8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SAMSN1Q9NSI8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SAMSN1Q9NSI8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SAMSN1Q9NSI8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SAMSN1Q9NSI8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SAMSN1Q9NSI8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SAMSN1Q9NSI8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SAMSN1Q9NSI8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SAMSN1Q9NSI8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SAMSN1Q9NSI8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SAMSN1Q9NSI8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SAMSN1Q9NSI8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SAMSN1Q9NSI8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SAMSN1Q9NSI8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SAMSN1Q9NSI8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SAMSN1Q9NSI8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SAMSN1Q9NSI8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SAMSN1Q9NSI8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SAMSN1Q9NSI8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SAMSN1Q9NSI8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SAMSN1Q9NSI8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SAMSN1Q9NSI8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SAMSN1Q9NSI8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SAMSN1Q9NSI8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SAMSN1Q9NSI8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SAMSN1Q9NSI8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SAMSN1Q9NSI8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SAMSN1Q9NSI8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SAMSN1Q9NSI8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SAMSN1Q9NSI8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SAMSN1Q9NSI8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SAMSN1Q9NSI8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SAMSN1Q9NSI8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SAMSN1Q9NSI8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SAMSN1Q9NSI8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SAMSN1Q9NSI8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SAMSN1Q9NSI8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SAMSN1Q9NSI8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SAMSN1Q9NSI8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SAMSN1Q9NSI8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SAMSN1Q9NSI8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SAMSN1Q9NSI8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SAMSN1Q9NSI8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SAMSN1Q9NSI8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SAMSN1Q9NSI8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SAMSN1Q9NSI8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SAMSN1Q9NSI8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SAMSN1Q9NSI8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SAMSN1Q9NSI8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SAMSN1Q9NSI8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SAMSN1Q9NSI8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SAMSN1Q9NSI8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SAMSN1Q9NSI8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SAMSN1Q9NSI8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SAMSN1Q9NSI8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SAMSN1Q9NSI8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SAMSN1Q9NSI8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SAMSN1Q9NSI8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SAMSN1Q9NSI8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SAMSN1Q9NSI8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SAMSN1Q9NSI8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SAMSN1Q9NSI8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SAMSN1Q9NSI8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SAMSN1Q9NSI8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SAMSN1Q9NSI8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SAMSN1Q9NSI8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SAMSN1Q9NSI8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SAMSN1Q9NSI8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SAMSN1Q9NSI8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SAMSN1Q9NSI8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SAMSN1Q9NSI8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SAMSN1Q9NSI8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SAMSN1Q9NSI8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SAMSN1Q9NSI8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SAMSN1Q9NSI8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SAMSN1Q9NSI8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SAMSN1Q9NSI8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SAMSN1Q9NSI8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SAMSN1Q9NSI8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SAMSN1Q9NSI8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SAMSN1Q9NSI8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SAMSN1Q9NSI8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SAMSN1Q9NSI8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SAMSN1Q9NSI8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SAMSN1Q9NSI8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SAMSN1Q9NSI8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SAMSN1Q9NSI8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SAMSN1Q9NSI8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SAMSN1Q9NSI8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SAMSN1Q9NSI8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms