Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX15Q9NRS6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX15Q9NRS6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX15Q9NRS6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX15Q9NRS6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX15Q9NRS6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX15Q9NRS6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX15Q9NRS6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX15Q9NRS6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX15Q9NRS6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX15Q9NRS6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX15Q9NRS6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX15Q9NRS6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX15Q9NRS6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX15Q9NRS6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX15Q9NRS6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX15Q9NRS6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX15Q9NRS6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX15Q9NRS6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX15Q9NRS6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX15Q9NRS6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX15Q9NRS6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX15Q9NRS6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX15Q9NRS6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX15Q9NRS6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX15Q9NRS6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX15Q9NRS6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX15Q9NRS6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX15Q9NRS6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX15Q9NRS6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX15Q9NRS6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX15Q9NRS6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX15Q9NRS6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX15Q9NRS6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX15Q9NRS6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX15Q9NRS6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX15Q9NRS6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX15Q9NRS6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX15Q9NRS6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX15Q9NRS6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX15Q9NRS6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX15Q9NRS6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX15Q9NRS6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX15Q9NRS6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX15Q9NRS6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX15Q9NRS6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX15Q9NRS6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX15Q9NRS6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX15Q9NRS6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX15Q9NRS6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX15Q9NRS6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX15Q9NRS6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX15Q9NRS6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX15Q9NRS6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX15Q9NRS6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX15Q9NRS6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX15Q9NRS6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX15Q9NRS6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX15Q9NRS6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX15Q9NRS6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX15Q9NRS6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX15Q9NRS6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX15Q9NRS6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX15Q9NRS6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SNX15Q9NRS6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SNX15Q9NRS6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX15Q9NRS6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX15Q9NRS6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX15Q9NRS6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX15Q9NRS6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX15Q9NRS6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX15Q9NRS6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX15Q9NRS6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX15Q9NRS6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX15Q9NRS6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX15Q9NRS6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX15Q9NRS6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX15Q9NRS6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX15Q9NRS6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX15Q9NRS6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX15Q9NRS6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX15Q9NRS6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX15Q9NRS6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX15Q9NRS6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX15Q9NRS6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX15Q9NRS6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX15Q9NRS6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX15Q9NRS6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX15Q9NRS6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX15Q9NRS6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX15Q9NRS6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX15Q9NRS6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX15Q9NRS6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX15Q9NRS6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX15Q9NRS6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX15Q9NRS6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX15Q9NRS6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX15Q9NRS6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX15Q9NRS6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX15Q9NRS6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms