Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HIPK3Q9H422 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HIPK3Q9H422 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HIPK3Q9H422 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HIPK3Q9H422 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HIPK3Q9H422 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HIPK3Q9H422 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HIPK3Q9H422 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HIPK3Q9H422 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HIPK3Q9H422 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HIPK3Q9H422 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HIPK3Q9H422 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HIPK3Q9H422 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HIPK3Q9H422 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HIPK3Q9H422 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HIPK3Q9H422 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HIPK3Q9H422 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HIPK3Q9H422 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HIPK3Q9H422 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HIPK3Q9H422 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HIPK3Q9H422 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HIPK3Q9H422 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HIPK3Q9H422 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HIPK3Q9H422 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HIPK3Q9H422 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HIPK3Q9H422 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HIPK3Q9H422 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HIPK3Q9H422 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HIPK3Q9H422 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HIPK3Q9H422 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HIPK3Q9H422 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HIPK3Q9H422 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HIPK3Q9H422 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HIPK3Q9H422 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HIPK3Q9H422 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
HIPK3Q9H422 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
HIPK3Q9H422 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HIPK3Q9H422 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HIPK3Q9H422 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HIPK3Q9H422 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HIPK3Q9H422 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HIPK3Q9H422 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HIPK3Q9H422 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HIPK3Q9H422 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HIPK3Q9H422 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HIPK3Q9H422 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HIPK3Q9H422 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HIPK3Q9H422 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HIPK3Q9H422 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HIPK3Q9H422 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HIPK3Q9H422 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HIPK3Q9H422 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HIPK3Q9H422 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HIPK3Q9H422 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HIPK3Q9H422 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HIPK3Q9H422 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HIPK3Q9H422 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIPK3Q9H422 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIPK3Q9H422 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIPK3Q9H422 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIPK3Q9H422 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIPK3Q9H422 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIPK3Q9H422 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIPK3Q9H422 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIPK3Q9H422 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIPK3Q9H422 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HIPK3Q9H422 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIPK3Q9H422 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIPK3Q9H422 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIPK3Q9H422 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIPK3Q9H422 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIPK3Q9H422 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HIPK3Q9H422 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HIPK3Q9H422 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HIPK3Q9H422 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HIPK3Q9H422 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HIPK3Q9H422 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HIPK3Q9H422 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HIPK3Q9H422 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HIPK3Q9H422 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HIPK3Q9H422 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HIPK3Q9H422 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HIPK3Q9H422 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HIPK3Q9H422 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HIPK3Q9H422 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HIPK3Q9H422 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIPK3Q9H422 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIPK3Q9H422 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIPK3Q9H422 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIPK3Q9H422 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIPK3Q9H422 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIPK3Q9H422 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIPK3Q9H422 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HIPK3Q9H422 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIPK3Q9H422 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIPK3Q9H422 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HIPK3Q9H422 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HIPK3Q9H422 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HIPK3Q9H422 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HIPK3Q9H422 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms