Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I9

LRRC27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC27Q9C0I9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC27Q9C0I9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC27Q9C0I9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC27Q9C0I9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC27Q9C0I9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC27Q9C0I9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC27Q9C0I9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC27Q9C0I9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC27Q9C0I9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC27Q9C0I9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC27Q9C0I9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC27Q9C0I9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC27Q9C0I9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC27Q9C0I9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC27Q9C0I9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC27Q9C0I9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC27Q9C0I9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC27Q9C0I9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC27Q9C0I9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC27Q9C0I9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC27Q9C0I9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC27Q9C0I9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC27Q9C0I9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC27Q9C0I9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC27Q9C0I9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC27Q9C0I9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC27Q9C0I9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC27Q9C0I9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC27Q9C0I9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC27Q9C0I9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC27Q9C0I9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LRRC27Q9C0I9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LRRC27Q9C0I9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRC27Q9C0I9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC27Q9C0I9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC27Q9C0I9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC27Q9C0I9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC27Q9C0I9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC27Q9C0I9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC27Q9C0I9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC27Q9C0I9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC27Q9C0I9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC27Q9C0I9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC27Q9C0I9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC27Q9C0I9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC27Q9C0I9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC27Q9C0I9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC27Q9C0I9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC27Q9C0I9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC27Q9C0I9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC27Q9C0I9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC27Q9C0I9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC27Q9C0I9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC27Q9C0I9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC27Q9C0I9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC27Q9C0I9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC27Q9C0I9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC27Q9C0I9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC27Q9C0I9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC27Q9C0I9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC27Q9C0I9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC27Q9C0I9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC27Q9C0I9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC27Q9C0I9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC27Q9C0I9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC27Q9C0I9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC27Q9C0I9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC27Q9C0I9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC27Q9C0I9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC27Q9C0I9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC27Q9C0I9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC27Q9C0I9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC27Q9C0I9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC27Q9C0I9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC27Q9C0I9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC27Q9C0I9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC27Q9C0I9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC27Q9C0I9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC27Q9C0I9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC27Q9C0I9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC27Q9C0I9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC27Q9C0I9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC27Q9C0I9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC27Q9C0I9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC27Q9C0I9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC27Q9C0I9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC27Q9C0I9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC27Q9C0I9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC27Q9C0I9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC27Q9C0I9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC27Q9C0I9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC27Q9C0I9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC27Q9C0I9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC27Q9C0I9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC27Q9C0I9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC27Q9C0I9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC27Q9C0I9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC27Q9C0I9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC27Q9C0I9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC27Q9C0I9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
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