Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZCCHC2Q9C0B9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZCCHC2Q9C0B9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZCCHC2Q9C0B9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZCCHC2Q9C0B9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZCCHC2Q9C0B9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZCCHC2Q9C0B9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZCCHC2Q9C0B9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZCCHC2Q9C0B9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZCCHC2Q9C0B9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZCCHC2Q9C0B9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZCCHC2Q9C0B9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZCCHC2Q9C0B9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZCCHC2Q9C0B9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZCCHC2Q9C0B9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZCCHC2Q9C0B9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZCCHC2Q9C0B9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZCCHC2Q9C0B9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZCCHC2Q9C0B9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZCCHC2Q9C0B9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZCCHC2Q9C0B9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZCCHC2Q9C0B9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZCCHC2Q9C0B9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZCCHC2Q9C0B9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZCCHC2Q9C0B9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZCCHC2Q9C0B9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZCCHC2Q9C0B9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZCCHC2Q9C0B9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZCCHC2Q9C0B9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZCCHC2Q9C0B9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZCCHC2Q9C0B9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZCCHC2Q9C0B9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZCCHC2Q9C0B9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZCCHC2Q9C0B9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZCCHC2Q9C0B9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZCCHC2Q9C0B9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZCCHC2Q9C0B9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZCCHC2Q9C0B9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZCCHC2Q9C0B9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZCCHC2Q9C0B9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZCCHC2Q9C0B9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZCCHC2Q9C0B9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZCCHC2Q9C0B9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZCCHC2Q9C0B9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ZCCHC2Q9C0B9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZCCHC2Q9C0B9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZCCHC2Q9C0B9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZCCHC2Q9C0B9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZCCHC2Q9C0B9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZCCHC2Q9C0B9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZCCHC2Q9C0B9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZCCHC2Q9C0B9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZCCHC2Q9C0B9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ZCCHC2Q9C0B9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ZCCHC2Q9C0B9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZCCHC2Q9C0B9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZCCHC2Q9C0B9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZCCHC2Q9C0B9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZCCHC2Q9C0B9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ZCCHC2Q9C0B9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZCCHC2Q9C0B9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZCCHC2Q9C0B9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZCCHC2Q9C0B9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZCCHC2Q9C0B9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZCCHC2Q9C0B9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZCCHC2Q9C0B9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZCCHC2Q9C0B9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZCCHC2Q9C0B9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZCCHC2Q9C0B9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZCCHC2Q9C0B9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZCCHC2Q9C0B9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZCCHC2Q9C0B9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZCCHC2Q9C0B9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZCCHC2Q9C0B9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZCCHC2Q9C0B9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZCCHC2Q9C0B9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ZCCHC2Q9C0B9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZCCHC2Q9C0B9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ZCCHC2Q9C0B9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZCCHC2Q9C0B9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZCCHC2Q9C0B9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZCCHC2Q9C0B9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZCCHC2Q9C0B9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZCCHC2Q9C0B9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZCCHC2Q9C0B9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZCCHC2Q9C0B9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZCCHC2Q9C0B9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZCCHC2Q9C0B9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZCCHC2Q9C0B9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ZCCHC2Q9C0B9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ZCCHC2Q9C0B9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZCCHC2Q9C0B9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ZCCHC2Q9C0B9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZCCHC2Q9C0B9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZCCHC2Q9C0B9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZCCHC2Q9C0B9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZCCHC2Q9C0B9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZCCHC2Q9C0B9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZCCHC2Q9C0B9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZCCHC2Q9C0B9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms