Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YTHDF1Q9BYJ9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
YTHDF1Q9BYJ9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YTHDF1Q9BYJ9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YTHDF1Q9BYJ9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YTHDF1Q9BYJ9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YTHDF1Q9BYJ9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YTHDF1Q9BYJ9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YTHDF1Q9BYJ9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YTHDF1Q9BYJ9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YTHDF1Q9BYJ9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YTHDF1Q9BYJ9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YTHDF1Q9BYJ9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YTHDF1Q9BYJ9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YTHDF1Q9BYJ9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YTHDF1Q9BYJ9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YTHDF1Q9BYJ9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YTHDF1Q9BYJ9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YTHDF1Q9BYJ9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YTHDF1Q9BYJ9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
YTHDF1Q9BYJ9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YTHDF1Q9BYJ9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YTHDF1Q9BYJ9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDF1Q9BYJ9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDF1Q9BYJ9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDF1Q9BYJ9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDF1Q9BYJ9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDF1Q9BYJ9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDF1Q9BYJ9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDF1Q9BYJ9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDF1Q9BYJ9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDF1Q9BYJ9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YTHDF1Q9BYJ9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YTHDF1Q9BYJ9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YTHDF1Q9BYJ9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YTHDF1Q9BYJ9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YTHDF1Q9BYJ9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YTHDF1Q9BYJ9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YTHDF1Q9BYJ9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YTHDF1Q9BYJ9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YTHDF1Q9BYJ9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YTHDF1Q9BYJ9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YTHDF1Q9BYJ9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
YTHDF1Q9BYJ9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YTHDF1Q9BYJ9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YTHDF1Q9BYJ9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YTHDF1Q9BYJ9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YTHDF1Q9BYJ9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YTHDF1Q9BYJ9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YTHDF1Q9BYJ9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YTHDF1Q9BYJ9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YTHDF1Q9BYJ9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YTHDF1Q9BYJ9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YTHDF1Q9BYJ9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YTHDF1Q9BYJ9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YTHDF1Q9BYJ9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YTHDF1Q9BYJ9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YTHDF1Q9BYJ9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YTHDF1Q9BYJ9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YTHDF1Q9BYJ9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YTHDF1Q9BYJ9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YTHDF1Q9BYJ9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
YTHDF1Q9BYJ9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDF1Q9BYJ9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDF1Q9BYJ9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDF1Q9BYJ9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDF1Q9BYJ9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDF1Q9BYJ9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDF1Q9BYJ9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDF1Q9BYJ9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDF1Q9BYJ9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDF1Q9BYJ9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDF1Q9BYJ9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDF1Q9BYJ9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDF1Q9BYJ9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDF1Q9BYJ9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDF1Q9BYJ9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDF1Q9BYJ9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDF1Q9BYJ9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YTHDF1Q9BYJ9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YTHDF1Q9BYJ9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
YTHDF1Q9BYJ9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YTHDF1Q9BYJ9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDF1Q9BYJ9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDF1Q9BYJ9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDF1Q9BYJ9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDF1Q9BYJ9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDF1Q9BYJ9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDF1Q9BYJ9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDF1Q9BYJ9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDF1Q9BYJ9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDF1Q9BYJ9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDF1Q9BYJ9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDF1Q9BYJ9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDF1Q9BYJ9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
YTHDF1Q9BYJ9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
YTHDF1Q9BYJ9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
YTHDF1Q9BYJ9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms