Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLDIP3Q9BY77 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLDIP3Q9BY77 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLDIP3Q9BY77 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLDIP3Q9BY77 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLDIP3Q9BY77 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLDIP3Q9BY77 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLDIP3Q9BY77 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLDIP3Q9BY77 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLDIP3Q9BY77 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLDIP3Q9BY77 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLDIP3Q9BY77 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLDIP3Q9BY77 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLDIP3Q9BY77 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLDIP3Q9BY77 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLDIP3Q9BY77 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POLDIP3Q9BY77 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLDIP3Q9BY77 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLDIP3Q9BY77 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POLDIP3Q9BY77 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLDIP3Q9BY77 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLDIP3Q9BY77 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLDIP3Q9BY77 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLDIP3Q9BY77 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POLDIP3Q9BY77 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLDIP3Q9BY77 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLDIP3Q9BY77 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLDIP3Q9BY77 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLDIP3Q9BY77 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLDIP3Q9BY77 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLDIP3Q9BY77 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLDIP3Q9BY77 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLDIP3Q9BY77 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLDIP3Q9BY77 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLDIP3Q9BY77 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLDIP3Q9BY77 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLDIP3Q9BY77 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLDIP3Q9BY77 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLDIP3Q9BY77 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLDIP3Q9BY77 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLDIP3Q9BY77 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLDIP3Q9BY77 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLDIP3Q9BY77 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLDIP3Q9BY77 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLDIP3Q9BY77 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLDIP3Q9BY77 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLDIP3Q9BY77 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLDIP3Q9BY77 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLDIP3Q9BY77 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLDIP3Q9BY77 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLDIP3Q9BY77 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLDIP3Q9BY77 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLDIP3Q9BY77 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLDIP3Q9BY77 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLDIP3Q9BY77 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLDIP3Q9BY77 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLDIP3Q9BY77 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLDIP3Q9BY77 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLDIP3Q9BY77 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLDIP3Q9BY77 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLDIP3Q9BY77 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLDIP3Q9BY77 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLDIP3Q9BY77 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLDIP3Q9BY77 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLDIP3Q9BY77 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLDIP3Q9BY77 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLDIP3Q9BY77 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLDIP3Q9BY77 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLDIP3Q9BY77 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLDIP3Q9BY77 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLDIP3Q9BY77 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLDIP3Q9BY77 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLDIP3Q9BY77 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLDIP3Q9BY77 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLDIP3Q9BY77 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLDIP3Q9BY77 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLDIP3Q9BY77 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLDIP3Q9BY77 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
POLDIP3Q9BY77 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLDIP3Q9BY77 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
POLDIP3Q9BY77 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLDIP3Q9BY77 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLDIP3Q9BY77 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
POLDIP3Q9BY77 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLDIP3Q9BY77 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLDIP3Q9BY77 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLDIP3Q9BY77 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLDIP3Q9BY77 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLDIP3Q9BY77 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLDIP3Q9BY77 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLDIP3Q9BY77 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLDIP3Q9BY77 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLDIP3Q9BY77 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLDIP3Q9BY77 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POLDIP3Q9BY77 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLDIP3Q9BY77 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLDIP3Q9BY77 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLDIP3Q9BY77 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLDIP3Q9BY77 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLDIP3Q9BY77 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms