Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BBS2Q9BXC9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BBS2Q9BXC9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BBS2Q9BXC9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BBS2Q9BXC9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BBS2Q9BXC9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BBS2Q9BXC9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BBS2Q9BXC9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BBS2Q9BXC9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BBS2Q9BXC9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BBS2Q9BXC9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BBS2Q9BXC9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BBS2Q9BXC9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BBS2Q9BXC9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BBS2Q9BXC9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BBS2Q9BXC9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BBS2Q9BXC9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BBS2Q9BXC9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BBS2Q9BXC9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BBS2Q9BXC9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BBS2Q9BXC9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BBS2Q9BXC9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BBS2Q9BXC9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BBS2Q9BXC9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BBS2Q9BXC9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BBS2Q9BXC9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BBS2Q9BXC9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BBS2Q9BXC9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BBS2Q9BXC9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BBS2Q9BXC9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BBS2Q9BXC9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BBS2Q9BXC9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BBS2Q9BXC9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
BBS2Q9BXC9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BBS2Q9BXC9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BBS2Q9BXC9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BBS2Q9BXC9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BBS2Q9BXC9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BBS2Q9BXC9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BBS2Q9BXC9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BBS2Q9BXC9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BBS2Q9BXC9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BBS2Q9BXC9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BBS2Q9BXC9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BBS2Q9BXC9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BBS2Q9BXC9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BBS2Q9BXC9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BBS2Q9BXC9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BBS2Q9BXC9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BBS2Q9BXC9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BBS2Q9BXC9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BBS2Q9BXC9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BBS2Q9BXC9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BBS2Q9BXC9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BBS2Q9BXC9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BBS2Q9BXC9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BBS2Q9BXC9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BBS2Q9BXC9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BBS2Q9BXC9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BBS2Q9BXC9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BBS2Q9BXC9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BBS2Q9BXC9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BBS2Q9BXC9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BBS2Q9BXC9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BBS2Q9BXC9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BBS2Q9BXC9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BBS2Q9BXC9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BBS2Q9BXC9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BBS2Q9BXC9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BBS2Q9BXC9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BBS2Q9BXC9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BBS2Q9BXC9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BBS2Q9BXC9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BBS2Q9BXC9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BBS2Q9BXC9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BBS2Q9BXC9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BBS2Q9BXC9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BBS2Q9BXC9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BBS2Q9BXC9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BBS2Q9BXC9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BBS2Q9BXC9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BBS2Q9BXC9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BBS2Q9BXC9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BBS2Q9BXC9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BBS2Q9BXC9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BBS2Q9BXC9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BBS2Q9BXC9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BBS2Q9BXC9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BBS2Q9BXC9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BBS2Q9BXC9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BBS2Q9BXC9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BBS2Q9BXC9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BBS2Q9BXC9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BBS2Q9BXC9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BBS2Q9BXC9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BBS2Q9BXC9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BBS2Q9BXC9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BBS2Q9BXC9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BBS2Q9BXC9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BBS2Q9BXC9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms