Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA7

TSSK1B, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK1BQ9BXA7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TSSK1BQ9BXA7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSSK1BQ9BXA7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSSK1BQ9BXA7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSSK1BQ9BXA7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSSK1BQ9BXA7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TSSK1BQ9BXA7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSSK1BQ9BXA7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSSK1BQ9BXA7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSSK1BQ9BXA7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSSK1BQ9BXA7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSSK1BQ9BXA7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSSK1BQ9BXA7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSSK1BQ9BXA7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSSK1BQ9BXA7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSSK1BQ9BXA7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSSK1BQ9BXA7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSSK1BQ9BXA7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSSK1BQ9BXA7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSSK1BQ9BXA7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSSK1BQ9BXA7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSSK1BQ9BXA7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSSK1BQ9BXA7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSSK1BQ9BXA7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSSK1BQ9BXA7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSSK1BQ9BXA7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TSSK1BQ9BXA7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSSK1BQ9BXA7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSSK1BQ9BXA7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSSK1BQ9BXA7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSSK1BQ9BXA7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TSSK1BQ9BXA7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSSK1BQ9BXA7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSSK1BQ9BXA7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSSK1BQ9BXA7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSSK1BQ9BXA7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSSK1BQ9BXA7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TSSK1BQ9BXA7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSSK1BQ9BXA7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSSK1BQ9BXA7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSSK1BQ9BXA7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSSK1BQ9BXA7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSSK1BQ9BXA7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSSK1BQ9BXA7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSSK1BQ9BXA7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSSK1BQ9BXA7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSSK1BQ9BXA7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSSK1BQ9BXA7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSSK1BQ9BXA7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSSK1BQ9BXA7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSSK1BQ9BXA7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSSK1BQ9BXA7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSSK1BQ9BXA7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSSK1BQ9BXA7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSSK1BQ9BXA7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSSK1BQ9BXA7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSSK1BQ9BXA7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSSK1BQ9BXA7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSSK1BQ9BXA7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSSK1BQ9BXA7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSSK1BQ9BXA7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSSK1BQ9BXA7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSSK1BQ9BXA7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSSK1BQ9BXA7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSSK1BQ9BXA7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSSK1BQ9BXA7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSSK1BQ9BXA7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSSK1BQ9BXA7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSSK1BQ9BXA7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSSK1BQ9BXA7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSSK1BQ9BXA7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSSK1BQ9BXA7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSSK1BQ9BXA7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSSK1BQ9BXA7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSSK1BQ9BXA7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSSK1BQ9BXA7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSSK1BQ9BXA7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSSK1BQ9BXA7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSSK1BQ9BXA7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TSSK1BQ9BXA7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSSK1BQ9BXA7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSSK1BQ9BXA7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSSK1BQ9BXA7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSSK1BQ9BXA7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSSK1BQ9BXA7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSSK1BQ9BXA7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TSSK1BQ9BXA7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSSK1BQ9BXA7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSSK1BQ9BXA7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSSK1BQ9BXA7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSSK1BQ9BXA7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSSK1BQ9BXA7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSSK1BQ9BXA7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSSK1BQ9BXA7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSSK1BQ9BXA7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSSK1BQ9BXA7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSSK1BQ9BXA7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSSK1BQ9BXA7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSSK1BQ9BXA7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSSK1BQ9BXA7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms