Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GORASP1Q9BQQ3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GORASP1Q9BQQ3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GORASP1Q9BQQ3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GORASP1Q9BQQ3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GORASP1Q9BQQ3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GORASP1Q9BQQ3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GORASP1Q9BQQ3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GORASP1Q9BQQ3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GORASP1Q9BQQ3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GORASP1Q9BQQ3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GORASP1Q9BQQ3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GORASP1Q9BQQ3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GORASP1Q9BQQ3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GORASP1Q9BQQ3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GORASP1Q9BQQ3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GORASP1Q9BQQ3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GORASP1Q9BQQ3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GORASP1Q9BQQ3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GORASP1Q9BQQ3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GORASP1Q9BQQ3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GORASP1Q9BQQ3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GORASP1Q9BQQ3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GORASP1Q9BQQ3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GORASP1Q9BQQ3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GORASP1Q9BQQ3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GORASP1Q9BQQ3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GORASP1Q9BQQ3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GORASP1Q9BQQ3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GORASP1Q9BQQ3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GORASP1Q9BQQ3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GORASP1Q9BQQ3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GORASP1Q9BQQ3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GORASP1Q9BQQ3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GORASP1Q9BQQ3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GORASP1Q9BQQ3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GORASP1Q9BQQ3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GORASP1Q9BQQ3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GORASP1Q9BQQ3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GORASP1Q9BQQ3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GORASP1Q9BQQ3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GORASP1Q9BQQ3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GORASP1Q9BQQ3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GORASP1Q9BQQ3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GORASP1Q9BQQ3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GORASP1Q9BQQ3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GORASP1Q9BQQ3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GORASP1Q9BQQ3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GORASP1Q9BQQ3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GORASP1Q9BQQ3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GORASP1Q9BQQ3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GORASP1Q9BQQ3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GORASP1Q9BQQ3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GORASP1Q9BQQ3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GORASP1Q9BQQ3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GORASP1Q9BQQ3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GORASP1Q9BQQ3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GORASP1Q9BQQ3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GORASP1Q9BQQ3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GORASP1Q9BQQ3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GORASP1Q9BQQ3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GORASP1Q9BQQ3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GORASP1Q9BQQ3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GORASP1Q9BQQ3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GORASP1Q9BQQ3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GORASP1Q9BQQ3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GORASP1Q9BQQ3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GORASP1Q9BQQ3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GORASP1Q9BQQ3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GORASP1Q9BQQ3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GORASP1Q9BQQ3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GORASP1Q9BQQ3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GORASP1Q9BQQ3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GORASP1Q9BQQ3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GORASP1Q9BQQ3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GORASP1Q9BQQ3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GORASP1Q9BQQ3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GORASP1Q9BQQ3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GORASP1Q9BQQ3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GORASP1Q9BQQ3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GORASP1Q9BQQ3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GORASP1Q9BQQ3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GORASP1Q9BQQ3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GORASP1Q9BQQ3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GORASP1Q9BQQ3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GORASP1Q9BQQ3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GORASP1Q9BQQ3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GORASP1Q9BQQ3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GORASP1Q9BQQ3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GORASP1Q9BQQ3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GORASP1Q9BQQ3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GORASP1Q9BQQ3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GORASP1Q9BQQ3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GORASP1Q9BQQ3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GORASP1Q9BQQ3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GORASP1Q9BQQ3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GORASP1Q9BQQ3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GORASP1Q9BQQ3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GORASP1Q9BQQ3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GORASP1Q9BQQ3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms