Protein–RNA interactions for Protein: Q99988

GDF15, Growth/differentiation factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF15Q99988 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GDF15Q99988 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GDF15Q99988 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GDF15Q99988 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GDF15Q99988 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GDF15Q99988 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GDF15Q99988 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GDF15Q99988 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GDF15Q99988 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GDF15Q99988 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GDF15Q99988 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GDF15Q99988 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GDF15Q99988 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GDF15Q99988 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GDF15Q99988 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GDF15Q99988 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GDF15Q99988 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GDF15Q99988 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GDF15Q99988 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GDF15Q99988 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GDF15Q99988 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GDF15Q99988 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GDF15Q99988 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GDF15Q99988 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GDF15Q99988 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GDF15Q99988 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GDF15Q99988 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GDF15Q99988 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GDF15Q99988 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GDF15Q99988 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GDF15Q99988 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GDF15Q99988 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GDF15Q99988 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GDF15Q99988 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GDF15Q99988 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GDF15Q99988 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GDF15Q99988 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GDF15Q99988 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GDF15Q99988 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GDF15Q99988 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GDF15Q99988 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GDF15Q99988 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GDF15Q99988 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GDF15Q99988 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GDF15Q99988 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GDF15Q99988 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GDF15Q99988 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GDF15Q99988 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GDF15Q99988 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GDF15Q99988 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GDF15Q99988 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
GDF15Q99988 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GDF15Q99988 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GDF15Q99988 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GDF15Q99988 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GDF15Q99988 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GDF15Q99988 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GDF15Q99988 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GDF15Q99988 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GDF15Q99988 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GDF15Q99988 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GDF15Q99988 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GDF15Q99988 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GDF15Q99988 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GDF15Q99988 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GDF15Q99988 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GDF15Q99988 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GDF15Q99988 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GDF15Q99988 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GDF15Q99988 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GDF15Q99988 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GDF15Q99988 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GDF15Q99988 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GDF15Q99988 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GDF15Q99988 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GDF15Q99988 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GDF15Q99988 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GDF15Q99988 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GDF15Q99988 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GDF15Q99988 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GDF15Q99988 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GDF15Q99988 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GDF15Q99988 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GDF15Q99988 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GDF15Q99988 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GDF15Q99988 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GDF15Q99988 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GDF15Q99988 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GDF15Q99988 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GDF15Q99988 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GDF15Q99988 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GDF15Q99988 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GDF15Q99988 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GDF15Q99988 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GDF15Q99988 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GDF15Q99988 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GDF15Q99988 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GDF15Q99988 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GDF15Q99988 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GDF15Q99988 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms