Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK4

BBS4, Bardet-Biedl syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS4Q96RK4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BBS4Q96RK4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BBS4Q96RK4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BBS4Q96RK4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BBS4Q96RK4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBS4Q96RK4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBS4Q96RK4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBS4Q96RK4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBS4Q96RK4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBS4Q96RK4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BBS4Q96RK4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBS4Q96RK4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBS4Q96RK4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBS4Q96RK4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBS4Q96RK4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBS4Q96RK4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBS4Q96RK4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BBS4Q96RK4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBS4Q96RK4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBS4Q96RK4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBS4Q96RK4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBS4Q96RK4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBS4Q96RK4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BBS4Q96RK4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBS4Q96RK4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBS4Q96RK4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS4Q96RK4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS4Q96RK4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS4Q96RK4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS4Q96RK4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS4Q96RK4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS4Q96RK4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS4Q96RK4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS4Q96RK4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBS4Q96RK4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBS4Q96RK4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BBS4Q96RK4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBS4Q96RK4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBS4Q96RK4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBS4Q96RK4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBS4Q96RK4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBS4Q96RK4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBS4Q96RK4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BBS4Q96RK4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBS4Q96RK4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBS4Q96RK4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBS4Q96RK4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBS4Q96RK4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBS4Q96RK4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBS4Q96RK4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBS4Q96RK4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBS4Q96RK4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBS4Q96RK4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBS4Q96RK4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBS4Q96RK4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBS4Q96RK4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBS4Q96RK4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBS4Q96RK4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBS4Q96RK4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBS4Q96RK4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBS4Q96RK4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBS4Q96RK4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBS4Q96RK4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBS4Q96RK4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBS4Q96RK4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBS4Q96RK4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBS4Q96RK4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBS4Q96RK4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBS4Q96RK4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBS4Q96RK4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBS4Q96RK4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBS4Q96RK4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBS4Q96RK4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBS4Q96RK4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBS4Q96RK4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBS4Q96RK4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBS4Q96RK4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
BBS4Q96RK4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms