Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF12Q96QT6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF12Q96QT6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF12Q96QT6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF12Q96QT6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF12Q96QT6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF12Q96QT6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF12Q96QT6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF12Q96QT6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF12Q96QT6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF12Q96QT6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF12Q96QT6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF12Q96QT6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF12Q96QT6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF12Q96QT6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF12Q96QT6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF12Q96QT6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF12Q96QT6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF12Q96QT6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF12Q96QT6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF12Q96QT6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF12Q96QT6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF12Q96QT6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF12Q96QT6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF12Q96QT6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF12Q96QT6 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF12Q96QT6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF12Q96QT6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF12Q96QT6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF12Q96QT6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF12Q96QT6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF12Q96QT6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF12Q96QT6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF12Q96QT6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF12Q96QT6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF12Q96QT6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF12Q96QT6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF12Q96QT6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF12Q96QT6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF12Q96QT6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF12Q96QT6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF12Q96QT6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF12Q96QT6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF12Q96QT6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF12Q96QT6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF12Q96QT6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms