Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SORCS2Q96PQ0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SORCS2Q96PQ0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SORCS2Q96PQ0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SORCS2Q96PQ0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SORCS2Q96PQ0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SORCS2Q96PQ0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SORCS2Q96PQ0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SORCS2Q96PQ0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SORCS2Q96PQ0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SORCS2Q96PQ0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SORCS2Q96PQ0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORCS2Q96PQ0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORCS2Q96PQ0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORCS2Q96PQ0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORCS2Q96PQ0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORCS2Q96PQ0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORCS2Q96PQ0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SORCS2Q96PQ0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SORCS2Q96PQ0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SORCS2Q96PQ0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SORCS2Q96PQ0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SORCS2Q96PQ0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SORCS2Q96PQ0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SORCS2Q96PQ0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SORCS2Q96PQ0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SORCS2Q96PQ0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SORCS2Q96PQ0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SORCS2Q96PQ0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SORCS2Q96PQ0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SORCS2Q96PQ0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SORCS2Q96PQ0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SORCS2Q96PQ0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SORCS2Q96PQ0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SORCS2Q96PQ0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SORCS2Q96PQ0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SORCS2Q96PQ0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SORCS2Q96PQ0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SORCS2Q96PQ0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SORCS2Q96PQ0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SORCS2Q96PQ0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SORCS2Q96PQ0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SORCS2Q96PQ0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SORCS2Q96PQ0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SORCS2Q96PQ0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SORCS2Q96PQ0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SORCS2Q96PQ0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SORCS2Q96PQ0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SORCS2Q96PQ0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SORCS2Q96PQ0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SORCS2Q96PQ0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SORCS2Q96PQ0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SORCS2Q96PQ0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SORCS2Q96PQ0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SORCS2Q96PQ0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SORCS2Q96PQ0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SORCS2Q96PQ0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SORCS2Q96PQ0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SORCS2Q96PQ0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SORCS2Q96PQ0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SORCS2Q96PQ0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SORCS2Q96PQ0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SORCS2Q96PQ0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SORCS2Q96PQ0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SORCS2Q96PQ0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SORCS2Q96PQ0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SORCS2Q96PQ0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SORCS2Q96PQ0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SORCS2Q96PQ0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SORCS2Q96PQ0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SORCS2Q96PQ0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SORCS2Q96PQ0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SORCS2Q96PQ0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SORCS2Q96PQ0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SORCS2Q96PQ0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SORCS2Q96PQ0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SORCS2Q96PQ0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SORCS2Q96PQ0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SORCS2Q96PQ0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SORCS2Q96PQ0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SORCS2Q96PQ0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SORCS2Q96PQ0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SORCS2Q96PQ0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SORCS2Q96PQ0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SORCS2Q96PQ0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SORCS2Q96PQ0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SORCS2Q96PQ0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SORCS2Q96PQ0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SORCS2Q96PQ0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SORCS2Q96PQ0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SORCS2Q96PQ0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SORCS2Q96PQ0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SORCS2Q96PQ0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SORCS2Q96PQ0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SORCS2Q96PQ0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SORCS2Q96PQ0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SORCS2Q96PQ0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SORCS2Q96PQ0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SORCS2Q96PQ0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SORCS2Q96PQ0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms